A diferencia de lo que ocurre con la energía, el flujo de materia en un ecosistema es cíclico. Los bioelementos presentes en los seres vivos,como oxígeno, carbono, hidrógeno, nitrógeno, azufre y fósforo van pasando de unos niveles tróficos a otros, de estos al medio ambiente, de donde de nuevo van a los organismos.

En todo ecosistema surgen ciclos de estos bioelementos, denominados ciclos biogeoquimicos, que se que se pueden definir como procesos naturales que reciclan elementos en diversas formas químicas del medio ambiente a los seres vivos, y viceversa.

Ocurren los ciclos de los elementos químicos en los ecosistemas porque, además de la energía, los organismos para vivir necesitan del suministro de ciertos elementos químicos, que aunque se encuentran en la biosfera, deben ser reciclados constantemente , con el propósito de asegurar su disponibilidad.

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Ciclos biogeoquimicos, ciclo de carbono y oxigeno