6. Replikation

Hur är DNA uppbyggt? Vilka är kvävebasparen? Vad är en kromosom?

Vad är ett genom? Vad "består" den av?

Ge exempel på fel som kan leda till mutationer.

Ge exempel på fel som kan leda till mutationer

Vad syftar ordet "fidelity" på?

Vilka polymeras misstag korrigeras av mismatch repair systemet?

Hur sker en missmatch repair på leading strand?

Är det vanligt att ribonukleotider byggs in i DNA?

Hur fungerar reparationen av ribonukleotider som används som kvävebaser i replikation?

Vilka mutationer ökar risken för att drabbas för kolorektalcancer?

När sker DNA-repair?

Vilka är det generella stegen vid DNA reparation? (bild)

Ge exempel på vanliga mutationer.

Varför är det viktigt att kunna reparera mutationer?

Vilken är "faran" om man inte åtgärdar mutationerna innan replikation?

Vilka processer ger felaktiga baser och hur sker reparationen?

Vad är en dimer och hur lagar man den?

Det är betydligt svårare att reparera DNA om båda strängarna gått sönder. Vilka två metoder finns för att reparera dessa fel och när används dessa?

Hur sker en lagning av "double-strand break" in DNA?

Vilken mutation ökar risken att drabbas av hudcancer?

Vilken princip använder sig av translesion syntes för att reparera skador i DNA? Vilket polymeras används?

Polymeras eta kan inte korrekturläsa när den replikerar "normalt DNA" trots det bildas de ändå inte mer mutationer jämfört med ett polymeras som kan korrekturläsa. Varför?

Vad är syftet med att göra en PCR?

I vilka tre viktiga steg kan man dela in ett PCR experiment? Och vad krävs för att kunna utföra experimentet?

Vad innebär steg 1, 2 och 3 i ett PCR experiment? Hur många gånger upprepas processen?

När kan PCR-tekniken användas?

Från vilken "håll" bygger polymeraset?

Var startar DNA-replikationen? Hur och m.h.a vilket enzym sker första steget? Finns reglering?

DNA-helikas binder in till helixen. Men vad krävs för att den ska börja bryta bindningarna mellan kvävebasparen?

Vilken funktion har både backbone och SSB för det enkelsträngade DNA:t?

Vad krävs för att polymeraset ska börja bygga? Hur vet den när den ska börja och var?

Vilka är målen med DNA-replikation?

Rita en schematisk bild på en pågående replikation

Vilket problem uppkommer när lagging strand byggs? (som inte uppkommer när leading strand byggs) Och hur löses det?

Vilka problem uppkommer när lagging strand byggs? (som inte uppkommer med leading strand) Hur löses detta?

Vad är ett okazakifragment?

Beskriv stegen som krävs för att förena okazakifragmenten och bilda en lång DNA-kedja utan brott.

Beskriv den eukaryota replikations gaffeln (bild).

Vad är supercoiled?

Hur fungerar telomeras? Hur ser strukturen ut?

Beskriv skillnaderna mellan omvänt transkriptas (OT), DNA-polymeras och RNA-polymeras.

Förklara hur man kan klona en gen genom att använda rekombinant DNA-teknik.

Vad kan konsekvensen bli av en mutation?

Vad kan konsekvenserna bli av en translokation?

Vilka kan konsekvenserna bli för en grövre kromosomförändring?

Vad innefattar nukleotidmetabolismen?

Vilka baser består av pyriner (2 ringar)?

Vad är pyrimidiner (1 ring)?

Beskriv översiktsbild på nukleotidmetabolismen (bild).

Beskriv de gemensamma reaktionerna för de novo-och salvage syntesen (bild). Vilka enzymer används i reaktionen?

Skillnad på salvage-syntes och de novo?

Ge exempel på cytostatika och var de verkar.

Ge exempel på sjukdomar (och dess behandling) som kan uppkomma vid rubbningar i nukleotidmetabolismen

Beskriv en DNA-helix. Vilka bindningar ingår och hur förhåller sig strängarna till varandra.

Varför binder just G-C och A-T?

Hur bestämmer den lokala konformationen den globala strukturen för en DNA-helix?

Vad medverkar till helixens stabilitet?

Beskriv major groove i B-DNA. Hur sker interaktioner och hur avläses sekvensen?

Hur ser minor groove ut? Vilka möjligheter finns till interaktioner?

Varför sker interaktioner lättare i major groove?

Ge exempel på hur en DNA-helix kan modifieras.

Hur påverkar metylering av cytostin DNA-helixen?

Ge exempel på DNA-skador som påverkar helixens struktur. Hur påverkas strukturen?

Ge exempel på några av de sekundär strukturer som RNA kan bilda. (bild)

Vad är en "sugar pucker"? Vilken funktion?