Estreptococos. Son responsables de, al menos, el 55% de las EB. De todos ellos el S. viridans está presente en el 75% de los casos. Las formas más frecuentes son el S. sanguis, el S. mutans y el S. milleri, este último puede provocar abscesos metastásicos. Se encuentran en la orofaringe y son sensibles a la penicilina.
El 20% de los casos provocados por estreptococos corresponde al S. bovis. Afecta fundamentalmente a personas mayores donde no es infrecuente el hallazgo de un tumor maligno del tubo digestivo (colon).
Otros estreptococos están presentes en el 5%.
Estafilococos. Son responsables del 30% de las EB, sobre todo el S. aureus y el S. epidermidis. Producen una gran afectación, una rápida destrucción y una evolución fulminante. Enterococos. Son responsables del 6% de las EB. Se encuentran en el tubo digestivo, la uretra y a veces en la boca. Se diferencian de los estreptococos por pruebas bioquímicas. Son resistentes a las penicilinas por lo que se añade en el tratamiento un aminoglucósido. Suelen existir antecedentes de manipulación de vías urinarias, traumatismos o alguna enfermedad.

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