BioInbformatica

Nota:

• rama computacional de la biología molecular.

1. un pco de la historia

   Nota:

   • Además de hacerle ganar a Alfred Sanger su primer Premio Nobel, la secuenciación de la insulina inauguró la era moderna de la biología molecular y estructural.  Tan pronto como las primeras computadoras estuvieron disponibles los primeros biólogos computacionales comenzaron a ingresar estos algoritmos manuales en los bancos de memoria. 
2. aplicaciones

   Nota:

   • os aportes principales de la bioinformática en el desarrollo del secuenciamiento del primer genoma humano.
   1. Adicionalmente se resumen los principales avances en cómputo desarrollados para responder a las demandas requeridas por..
      1. los métodos de secuenciamiento de última generación para lograr re-secuenciar un genoma humano
3. alcances
   1. La capacidad de recibir, ordenar, procesar, empaquetar e interpretar miles de datos derivados de diferentes investigaciones es una de las cualidades de esta rama del conocimiento que mezcla la computación con las ciencias de la vida.
4. limitaciones
   1. la mayor parte de las técnicas y sistemas encontrados en bioinformática se basan en interpolar información a partir de la ya existente. Son muy comunes técnicas del estilo de anotación por semejanza y ‘culpable por asociación’.
5. herramientas
   1. La más conocida herramienta de biología es BLAST un algoritmo para determinar la similitud de secuencias arbitrarias con otras secuencias.
      1. El NCBI proporciona una implementación muy utilizada, basada en web, y que trabaja sobre sus bases de datos.
6. El análisis de Secuencias de Proteínas

   Nota:

   • Los bioquímicos se dieron cuenta que las proteínas eran moléculas muy grandes compuestas de un gran número de aminoácidos recogidos a partir de una selección de 20 "sabores" con nombres tales como alanina, glicina, tirosina, glutamina, y así sucesivamente.
7. lectura de secuencia de ADN

   Nota:

   • Una secuencia de ADN se define siempre como la sucesión de sus nucleótidos constituyentes listados del  5' a 3' terminal (es decir, el final). 
   1. TGACT = Timina – Guanina – Adenina – Citosina - Timina
8. Palíndromos en secuencias de ADN

   Nota:

   •  Corresponden a cadenas frente a frente de la misma molécula de ADN.   
   1. Las secuencias palindrómicas no son meramente una curiosidad; desempeñan importantes funciones biológicas.
9. Regiones codificantes del ADN: Suponiendo Trabajar con Secuencias de Proteínas

   Nota:

   • La sucesión precisa de los aminoácidos constituyentes de una proteína es lo que define una molécula de proteína dada. La primera estructura tridimensional de una proteína fue determinada en 1958 por los doctores Kendrew y Perutz, utilizando la complicada técnica de cristalografía de rayos X.