Afleidd einkenni er einkenni sem hefur þróast frá ancestral state. Afleidd einkenni eru notuð til að búa til þróunartré.
Forsöguleg
Nota:
Sameiginleg forsöguleg einkenni eru þau einkenni sem tegundir eiga sameiginlegt með forföður eða feðrum sínum. Þau eru ekki notuð til að búa til þróunartré.
Homoplasy
Nota:
Karakter eða einkenni eru homoplasious ef þau hafa þróast sjálfstætt tvisvar eða oftar, og eru því ekki með sama uppruna. Dæmi: Vængur í leðurblöku og vængur á fugl.
Ruglandi
Nota:
Homoplasious einkenni - sem hafa gengið í gegnum samhliða þróun
(convergent) eða þróunarlegt afturkall (evolutionary reversal) skapa
ruglandi vísbendingar um phylogeny.
Clade
Monophyletic hópar
Nota:
Monophyletic hópar er í raun það sama og clade, en það er sett eða hópur af tegundum sem hafa þróast eða afleiðst frá einum sameiginlegum forföður.
Maximum parsimony
Nota:
"The best estimate of the true phylogeny is the one that requires us to postulate the fewest evolutionary changes."
Systurhópar
Nota:
Groups derived from a common ancestor that is not shared with any other groups
Molecular clocks
Nota:
Sameindaklukkur geta gert okkur kleift að gera ráð fyrir algjörum tíma (estimate the absolute time) síðan hópar (taxa) greindust í sundur - ef við getum vitað hversu hratt hún tikkar.
Haplotypes (setraðir)
DNA - raðir
Genatré
Phylogenetic analysis
Vandamál
Söfnun gagna
Anatomical characters
Homoplasy mjög algengt
Eyðing
Nota:
The process of evolution often erases the traces of prior evolutionary history
Hröð aðgreining
Nota:
Some lineages diverge so rapidly that there is little opportunity for the ancestors of each monophyletic group to evolve distinctive synapomorphies.
Vitlaust phylogeny
Nota:
An accurately estimated gene tree may imply the wrong species phylogeny
Hybridization
Nota:
Relationships among closely related species may be obscured by low levels of interbreeding between species.