AMP: Proyecto final de Bioinformática: Estudio de las variantes de her2, de cáncer mama.

maricefv
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Durante los primeros meses del semestre se han abordado temas como el cáncer y el uso de herramientas moleculares para el diagnóstico de distintas patologías, como la obtención de anticuerpos monoclonales mediante la tecnología de fago display. Se realiza una propuesta de ejercicio que ponga enpráctica todo lo aprendido.

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Objetivos: Se propone un ejercicio teórico donde el estudiante ponga en práctica lo aprendido y sea capaz de diseñar una estrategia que permita aportar mejoras en el estudio de una enfermedad tan importante como lo es el cáncer de mama. Para esto deberá realizar un estudio sobre las variantes her2, tanto a nivel de mutaciones del gen, variantes transcripcionales, variantes traduccionales y postraduccionales
Título del Proyecto: 6695ece8-8378-4f44-bf0b-21f8265b2369.jpg (image/jpg) Estudio de las variantes her2 de cáncer de mama y aplicación de estrategias moleculares de diagnóstico
Documentos necesarios: Deben entregar un informe escrito donde contesten a las preguntas que se realizan en "Datos de Partida"
Datos de partida Primeramente abordando el estudio de las variantes transcripcionales, de algunas de las cuales se habla en los papers adjuntos (Se adjuntan 6). En cuanto al resto de variantes transcripcionales, las cuales aún no han sido caracterizadas, se encuentran en la base de datos "nucleotide" de pubmed con los códigos: Variante 1 NM_004448.3 GI:584277099 2 NM_001005862.2 GI:584277101 3 NM_001289936.1 GI:584277102 4 NM_001289937.1 GI:584277105 5 NM_001289938.1 GI:584277108 6 NR_110535.1 GI:584277132
La propuesta es elaborar una estrategia para producir anticuerpos monoclonales para detectar específicamente por ejemplo la variante delta16-HER2. Algunos de los puntos que se deben tocar son: 1-¿Qué información es necesaria para ello? 2-¿Qué estrategia es la más idónea para la producción de ese anticuerpo? 3-¿Qué materiales y qué métodos se requieren para llevarla a cabo? 4-¿Cuánto tiempo estimarías que llevaría poner en marcha la producción? 5-¿Qué coste estimas que puede tener?
Los estudiantes tendrán cuatro meses para realizar este proyecto que será evaluado en grupos de 2 estudiantes al final del curso y que tendrá una ponderación de 20% (proyecto escrito) y 10% la exposición final sobre la nota final de la asignatura: Biología Molecular. Se dedican varias sesiones de carácter práctico (bioinformática) para, por un lado, ayudar a los alumnos en la toma de decisiones inicial, pero pueden consultar cualquier inquietud en las horas de consulta que tienen con el profesor semanalmente. Se hacen debates por grupo, sobre los 6 trabajos previamente entregados como antecedentes a la investigación. Los estudiantes podrán constatar la aplicabilidad y utilidad de las técnicas aprendidas durante el curso. Tendrán la oportunidad de compartir sus logros públicamente y recibir retroalimentación de compañeros y profesores que servirán como jurado de su propuesta final.