Alineamiento de secuencias

annie_mv
Mind Map by annie_mv, updated more than 1 year ago
annie_mv
Created by annie_mv over 6 years ago
42
1

Description

Mind Map on Alineamiento de secuencias, created by annie_mv on 10/10/2013.

Resource summary

Alineamiento de secuencias
1 Alineamientos múltiples
1.1 Clustal W: Para propósitos en general de alineamientos múltiples ya sea DNA o proteínas
1.2 COBALT: constraint-based alignment tool para alineamientos de proteínas
1.3 Clustal X: windows interface for the ClustalW multiple sequence alignment program.
1.4 T-Coffe: Alinea RNA, DNAo proteínas
1.5 MUSCLE: Especial para proteínas y alineamientos medios
2 Alineamientos locales
2.1 Blastn:Más comúnmente usado para comparar secuencias nucleotídicas contra una base de datos
2.2 Blastp: Blas con gaps, compara secuencias aminoacídicas y usa matrizes BLOSUM o PAM
2.3 Blast2seq: Alineamiento local de dos secuencias
3 Alineamiento global
3.1 Emboss Needle: Para 2 secuencias utillizando el algoritmo Needleman-Wunsch
3.2 Emboss Stetcher: Versión mejorada del algoritmo N-W.Permite alinear secuencias más largas
3.3 Emboss Matcher: Identifica similitudes locales de 2 seq usando LALIGN
3.4 Emboss Water: Usa el algoritmo Smith-Waterman para realizar alineamiento local de 2 seq
3.5 Needleman-Wunsch: Algoritmo para alineamientos globales
4 Programas
4.1 BioEdit: Easy-to-use sequence alignment editor and sequence analysis program
4.2 MEGA:alineamientois múltiples, locales, árboles filogenéticos, etc
Show full summary Hide full summary

Similar

AQA GCSE Physics Unit 2.2
Matthew T
French Essay Writing Vocab
caitlindavies8
Types and Components of Computer Systems
Jess Peason
GCSE AQA Biology - Unit 1
James Jolliffe
ExamTime Quick Guide to Getting Started
Andrea Leyden
Peace and Conflict Flashcards - Edexcel GCSE Religious Studies Unit 8
nicolalennon12
Atomic numbers and mass numbers quiz
Sarah Egan
Mapa Mental Estructura gramatical presente simple inglés
Maria Paz Cornejo
Proyecto académico pedagógico solidario
kariina jaime
ARCO REFLEJO
Alejandra Garcia
POLÍTICA ECONÓMICA
AMADO S JOHAN