Aplicaciones de la genómica en procariotas.

Vanessa Cañón
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Mapa conceptual basado en artículos sobre las aplicaciones que puede llegar a tener la genómica en procariotas
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Aplicaciones de la genómica en procariotas.
1 Aplicaciones
1.1 Diversidad procariotica PH UP HugenHoLTZ.
1.2 Anotación de genomas con Eugen-P.
1.3 Epidemiología genomica Eschericha coli.
1.4 Pan-PCR.
1.5 Toxina Shiga producida por Eschericha coli.
1.6 Secuenciación en microbiología clínica.
1.7 Microsatelite polimorfícos.
2 ¿Qué es?
2.1 Génomica.
2.1.1 Estudio de los genes.
2.1.2 DNA y RNA
3 Instrumentos variables.
3.1 Los protones secuenciados.
3.2 Open source genomica.
3.3 Ion tunent PGM.
3.4 Repeticiones y en tandem.
3.5 Dendogramas.
3.6 Gráficas circulares.
3.7 Enfoque de rRNA.
3.8 Ciclo completo.
3.9 Eugene-P.
3.10 Espectrometria de masas.
3.11 Rendimiento de RNA-Seq.
3.12 Cepas pacientes clínicos.
3.13 Herramientas Cueb.
3.14 Software CD-Hit
3.15 Ion protones secuenciados.
3.16 Soleta secuenciado.
4 Resultados.
4.1 Parámetros.
4.1.1 Match.
4.1.2 Mismatch
4.1.3 Indel.
4.1.4 Flank.
4.2 Conjunto de datos.
4.3 Resistencia de genoma.
4.4 Anotación de genes.
4.5 Eficacia de Eschericha coli.
4.6 Comparación cromosómica.
4.7 PCR-Multiplex.
4.8 Secuenciación
4.8.1 Nucleotido
4.8.2 Genomas.
5 Conclusiones.
5.1 Mejorar la salud del paciente.
5.2 Cepa virulenta.
5.3 RNA-seq.
5.4 Base de datos.
5.5 Herramienta bioinformática.
5.6 Genomas secuencidados.
5.7 Pan- PPCR.
5.7.1 Genomas bacterianos.
6 Métodos.
6.1 Secuenciación.
6.2 Detección microratelites.
6.3 Croscion sitio Web
6.4 Análisis bioinformáticos.
6.5 Diversidad procariota.
6.5.1 Nucleótidos secuencias.
6.5.2 Anotación de genes.
6.6 Transción de filogenia.
6.7 Cultivo de la No cultivada.
6.8 Genomas del entorno.
6.9 Cepas bacterianas.
6.10 Condición de crecimiento.
6.11 PCR.
6.12 Preparación del genoma.
6.13 Secuencia plumina.
7 Tipo de muestras.
7.1 B. anthras.
7.2 M. tuberculosis.
7.3 P. aurugunosa.
7.4 Proteobacteria.
7.5 Firmicutes.
7.6 Bacteroides.
7.7 Actinobacterias.
7.8 Sinorhizobium meliloti.
7.9 Eschericha coli.
7.10 Pacientes clínicos.
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