DNA cromosomal

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Breve explicación sobre la extracción de DNA cromosomal
Daniela Monroy
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Daniela Monroy
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DNA cromosomal
  1. "Purificación Salina"
    1. Pasos
      1. 1. Lisis celular
        1. Mediante un detergente aniónico en presencia de conservantes y tratamiento con RNAsa
          1. 2. Se eliminan proteínas y contaminantes celulares
            1. Mediante precipitación salina
              1. 3. Aislamiento de DNA genómico
                1. Precipitación en presencia de alcohol y se disuelve en agua o slc. conservante
        2. Aislamiento
          1. 1. Preparación de muestras
            1. Muestra fresca o congelada, se guardaran 10 mL de la muestra en congelación hasta su uso
              1. 2. Lisis celular
                1. Añadir 0.5 mL de suspeción bacteriana en un tubo eppendorf
                  1. Centrifugar a 13.000–16.000 g durante 5 segundos. Eliminar el máximo posible de sobrenadante
                    1. -Añadir 300 µl de la solución de lisis y pipetear suavemente hacia arriba y hacia abajo hasta que las células queden resuspendidas de nuevo.
                      1. Incubar la muestra a 80 ºC durante 5 minutos para lisar las células.
                        1. Enfriar la muestra hasta temperatura ambiente.
                  2. 3. Digestión de RNA
                    1. Añadir 1.5 µl de la solución de RNAsa A al lisado celular. Mezclar bien la muestra, invirtiendo el tubo 25 veces. Incubar a 37 ºC durante 15–60 minutos.
                      1. 4. Precipitación de proteínas
                        1. Enfriar la muestra hasta temperatura ambiente. Añadir 100 µl de la solución de precipitación de proteínas al lisado celular previamente tratado con RNAsa y agitar vigorosamente durante 20 segundos, y centrifugar a 13.000–16.000 g durante 3 minutos.
                          1. 5. Precipitación de DNA
                            1. Decantar el sobrenadante (que contiene el DNA) a un tubo Eppendorf de 1’5 ml que contenga 300 µl de isopropanol puro
                              1. Mezclar la muestra y centrifugar a 13000-16000 x 1 min
                                1. Eliminar el sobranadante por decantación
                                  1. Añadir 300 µl de etanol al 70%. Invertir el tubo varias veces
                                    1. Centrigugar a 13000-16000 x 1 min, posteriormente eliminar el EtOH por decantación
                                      1. Escurrir el tubo en papel absorbente y dejar secar la muestra
                              2. 6. Hidratación de DNA
                                1. Añadir 50 µl de la solución de hidratación del DNA
                                  1. Rehidratar el DNA a T amb durante toda la noche / Calentar a 65°C x 1 hr
                                    1. Guardar el DNA de 2-8°C hasta sy uso
                    2. Visualización en gel de agarosa
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