La razón principal de la conquista era la implantación de la fe cristiana entre los indigenas, por lo que solicitó el envío de frailes a las nuevas tierras conquistadas. En 1524 llegó a la Nueva España un grupo de doce frailes franciscanos.
Cada fraile al llegar se le imponía dos tareas: aprender una o varias lenguas indigenas y conocer las costumbres locales. Su principal labor fue implantar la fe cristiana entre los naturales por medio de la prédica, la preparación de catequistas, la redacción de doctrinas y la administración de los sacramentos como son el bautizo y el matrimonio.
Su obra no se detuvo ahi: congregaron a los indigenas en nuevas poblaciones, levantaron conventos, capillas e iglesias, construyeron caminos, puentes y acueductos, crearon hospitales y escuelas donde enseñaban diversos oficios y registraron las costumbres e historia de los antiguos pueblos indigenas.

Entre los principales frailes que realizaron la evangelizacion fueron:
Fray Toribio de Benavente (1491-1569)
Fray Juan de Zumárraga (1468-1548)
Fray Bartolomé de las Casas (1474-1566)
Vasco de Quiroga (1470-1565)
Fray Bernardino de Sahagún (1499-1590)
Fray Pedro de Gante (1480-1572)

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Los frailes como participes de la evangelización en la época colonial