Contemporary Lab Skills - Exam 2

Questão 1 de 100

1

What does PCR stand for?

Selecione uma das seguintes:

Polymerase Chain Reaction
Polyamorous Consensual Relationship
Polymorphic Chain Reaction
Polymorphic Contrasting Reaction

Explicação

Questão 2 de 100

1

Selecione da lista do Menu para completar o texto.

PCR is typically the ( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

Explicação

Questão 3 de 100

1

What is the main significance of PCR vs other methods?

Selecione uma das seguintes:

PCR avoids the DNA cloning process
PCR promotes the DNA cloning process
PCR promotes the RNA cloning process
PCR avoids the RNA cloning process

Explicação

Questão 4 de 100

1

PCR amplifies all included DNA segments, which allows us to measure general information about the DNA, such as length and total composition.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 5 de 100

1

What determines the segment of DNA that is amplified by PCR?

Selecione uma das seguintes:

Primers
Template DNA
Buffer
dNTPs

Explicação

Questão 6 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

DNA amplification after PCR is ( less, greater ) than 10^( 6, 5, 10, 12 )x

Explicação

Questão 7 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

PCR amplification requires ( little, a large amount of ) template DNA, but is highly ( susceptible, resistant ) to contamination.

Explicação

Questão 8 de 100

1

______________ is a thermostable DNA polymerase used to automate the repetitive steps in the polymerase chain reaction (PCR) technique.

Selecione uma das seguintes:

Taq polymerase
Qat polymerase
Thermopolymerase
Therm polymerase

Explicação

Questão 9 de 100

1

Which of the following is a requirement of PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Thermocycler
Template DNA
Primers
Thermostable DNA polymerase
Agarose Gel
Electric Current

Explicação

Questão 10 de 100

1

What kind of primers are used in PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Forward
Reverse
One-way
Two-way

Explicação

Questão 11 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

Using dNTP, or ( deoxynucleotide triphosphate, deoxynucleic triptophosphorous, deoxynucleotide triptophosphate, deoxynucleic triphosphate ), during the ( extension, replication, conditioning ) phase of PCR provides single bases ready to go into DNA and double it, like building blocks.

Explicação

Questão 12 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

DNA polymerases (DNAPs)...

- Add dNTPs to ( elongate, compress ) primer
- Require pre-existing ( oligonucleotide, phosphodiester ) (primer) with free ( 3' -OH, 5' -OH, 3' -PO4, 5' -PO4 )
- Read DNA template strand & inserts complementary ( deoxyribonucleotide (dNTP), DNA polymerase (DNAP), deoxyribose (dRTP) ) of the next unpaired nucleotide in the template
- Form ( phosphodiester, oligonucleotide, deoxyribonucleoide (dNTP) ) bond between ( 3' -OH, 5' -PO4, 5' -OH, 3' -PO4 ) of ( oligonucleotide, phosphodiester ) & ( 5' -PO4, 3' -OH, 3' -PO4, 5' -OH ) of ( deoxyribonucleotide (dNTP), oligonucleotide, phosphodiester )
- DNA synthesis proceeds ( 5'-->3', 3'-->5' )
- Template strand read ( 3'-->5', 5'-->3' )

Explicação

Questão 13 de 100

1

Select all that apply to DNA polymerases for PCR

Selecione uma ou mais das seguintes:

Thermostability is essential
Optimum polymerase activity at 72 degrees C, but can withstand up to 95 degrees C
Use exonuclease deficient forms
3'-->5' exonuclease activity may modify/degrade primers under initial sub-optimal conditions
Optimum polymerase activity at 65 degrees C, but can withstand up to 82 degrees C
Use endonuclease deficient forms
5'-->3' exonuclease activity may modify/degrade primers under initial sub-optimal conditions

Explicação

Questão 14 de 100

1

Match the DNA polymerases with their description

❌
- Taq Polymerase
- In hot springs

❌
- deep ocean vents
...- extends templates >12kb
...- proofreading ability
- Manipulation of Vent -->Deep Vent
...- Greater thermostability
...-Lacks exonuclease (exo-) component

❌
- Extends long templates
- Proofreading ability

❌
- RT at 70 degrees C + Mn^2+
- similar to RNA-PCR without cDNA

❌
- Proofreading activity
- Efficiently incorporates radiolabeled dNTPs
- Good for generating DNA probes

Arraste e solte para completar o texto.

Thermus aquatics

Thermococcus litoralis

Thermus maritima (UITma)

Thermus thermophilus (Tth)

Pfu DNA polymerase (marine bacterium)

Explicação

Questão 15 de 100

1

How long are typical PCR primers?

Selecione uma das seguintes:

20-30 bp
30-40 bp
10-20 bp
40-50 bp

Explicação

Questão 16 de 100

1

Select all that apply to a good PCR primer

Selecione uma ou mais das seguintes:

complement flanking DNA
not self-complementary
avoids potential secondary structure
matched GC content
similar melting temp
higher melting temp
complements itself
cannot complement flanking DNA
avoids potential tertiary structure

Explicação

Questão 17 de 100

1

Using software such as Oligo and Primer to calculate precise times and temperatures for PCR primer is an option, but calculations made by the researcher should be accurate enough.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 18 de 100

1

Which of the following are major components in a PCR reaction mixture?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Target DNA
Primers
DNA Polymerase
dNTPs
Buffer appropriate for enzyme
dNADs
deoxyribonuclease

Explicação

Questão 19 de 100

1

Which of the following should be considered when choosing a buffer for PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

enzyme activity
primer/template binding
effective incorporation of dNTPs
optimization for Mg^2+
optimization for P^+
DNA length

Explicação

Questão 20 de 100

1

The PCR cycle has which three steps?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Denaturation
Annealing
Extension
Buffering
Contraction

Explicação

Questão 21 de 100

1

What is the significance of the denaturing phase of PCR?

Selecione uma das seguintes:

It allows the selected region for amplification to be accessible to enzymes
It allows primers to anneal to the template DNA
It extends the primers beyond the target DNA

Explicação

Questão 22 de 100

1

Denaturation of DNA occurs at what temperature?

Selecione uma das seguintes:

90 degrees C
80 degrees C
85 degrees C
75 degrees C

Explicação

Questão 23 de 100

1

Which of the following occurs during the annealing phase of PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

reaction mixture cooled to 40-65 degrees C
Primers anneal to template DNA
precise temperature is critical and must be defined to avoid synthesis of other products
template dsDNA denatured by heating above 90 degrees C
temperature is raised to 72 degrees C
primers extended beyond target DNA
Primers extended from 3' -OH by thermostable DNA polymerase

Explicação

Questão 24 de 100

1

Which of the following occurs during the extension phase of PCR

Selecione uma ou mais das seguintes:

Temperature is raised to 72 degrees C
Primers extended from 3' -OH by thermostable DNA polymerase
Primers extended beyond target DNA
Sequence at 3' end contains sequence complementary to other primer
reaction mixture cooled to 40-50 degrees C
Primers anneal to template DNA
Template dsDNA denatured by heating above 90 degrees C

Explicação

Questão 25 de 100

1

Successive PCR cycles yield fragments precisely delimited by the primer.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 26 de 100

1

Which of the following applies to Agarose Gel electrophoresis (AGE) PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Run PCR products on gel alongside size standards
Look for band of predicted size
Original method
Semi-quantitative at best
Monitor accumulation of PCR products
Quantitative
Use fluorescent-labeled primers, probes, or fluorochromes
Based on Fluorescent Resonance Energy Transfer (FRET)

Explicação

Questão 27 de 100

1

Which of the following applies to Real-time PCR

Selecione uma ou mais das seguintes:

Monitor accumulation of PCR products during cycling
Quantitative
Use fluorescent-labeled primers, probes, or fluorochromes
Based on fluorescent Resonance Energy Transfer (FRET)
Run PCR products on gel alongside size standards
Look for band of predicted size
Orignal method
Semi-quantitative at best

Explicação

Questão 28 de 100

1

Label the types of Real-Time PCR

Arraste a resposta correta para cada ponto laranja.

Light Cycler Primers

Molecular Beacons

UFO PCR

Photon Cycler Primers

Taqman PCR Assay

Reporter-Quencher Assay

Scorpion Assay

Inchworm Assay

Explicação

Questão 29 de 100

1

What is the main benefit of using PCR over cloning?

Selecione uma das seguintes:

PCR is faster
PCR produces more accurate results
PCR requires less preparation
PCR is generally cheaper

Explicação

Questão 30 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

In PCR, "RAPD" stands for...

( Rapid, Renentive ) ( Amplification, Annealing ) of ( Polymorphic, Phosphodiester ) DNA

Explicação

Questão 31 de 100

1

Which of the following applies to RAPD PCR Analysis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

One or both primers are random sequences
Yields discrete bands on gel
Alteration in fragment length due to insertions/deletions between primer sites
Reproducibly identify and organism/species
Differentiate between various mutants
Based on insertions/deletions in gene sequence among individuals/genes
Amplification using 1 primer

Explicação

Questão 32 de 100

1

Which of the following applies to AFLP PCR analysis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Based on insertions/deletions in gene sequence among individuals/species
PCR amplification of specific gene(s)
Type of DNA fingerprint analysis
Amplification using 1 primer
One or both primers are random sequences
Yields discrete bands on gels
Alteration in fragment length due to insertions/deletions between primer sites

Explicação

Questão 33 de 100

1

PCR is an effective replacement for cloning

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 34 de 100

1

Cloning PCR products involves which of the following?

Selecione uma das seguintes:

In vitro protein synthesis
In vivo protein synthesis
In vitro DNA synthesis
In vivo DNA synthesis

Explicação

Questão 35 de 100

1

What are the initial problems associated with Direct PCR sequencing?

Selecione uma ou mais das seguintes:

sequencing requires ssDNA
Short PCR products re-anneal rapidly
Prevent annealing of sequencing primers
Bias amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants
Selectively remove 1 strand after sequencing

Explicação

Questão 36 de 100

1

What are the solutions for problems associated with direct PCR sequencing?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Bias amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants
Selectively remove 1 strand after synthesis
Sequencing requires ssDNA
Short PCR products reanneal rapidly
Prevent annealing of sequencing primers

Explicação

Questão 37 de 100

1

Select all the denaturants used for direct PCR sequencing

Selecione uma ou mais das seguintes:

Formamide
Dimethylsulfoxide
Formaldehyde
Dihydrogen monoxide

Explicação

Questão 38 de 100

1

How is one strand selectively removed after synthesis during direct PCR sequencing?
(Select 2)

Selecione uma ou mais das seguintes:

Incorporate biotin into 1 primer
Affinity chromatography with bound streptavidin removes biotinylated strand
Incorporate formamide into 1 primer
HPLC chromatography with bound streptavidin removes biotinylated strand
HPLC chromatography with bound straptovitamin removes biotinylated strand

Explicação

Questão 39 de 100

1

This is a depiction of which kind of PCR sequencing?

Selecione uma das seguintes:

Direct PCR sequencing
PCR cycle sequencing

Explicação

Questão 40 de 100

1

This is a depiction of which type of PCR sequencing?

Selecione uma das seguintes:

PCR cycle sequencing
Direct PCR sequencing

Explicação

Questão 41 de 100

1

Which of the following applies to PCR cycling?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Amplification using 1 primer
Uses about 20 PCR cycles to complete
Detected using Fluorescent ddNTPs
Detected using Radiolabeled ddNTPs
BIas amplification for 1 strand (primer ratio 100:1)
Use denaturants

Explicação

Questão 42 de 100

1

RT-PCR stands for...

Selecione uma das seguintes:

Reverse Transcriptase PCR
Reverse Terminal PCR
Repeating Transcriptase PCR
Repeating Terminal PCR

Explicação

Questão 43 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

Reverse Transcriptase converts ( mRNA, cDNA, ddDNA, rRNA ) to ( cDNA, mRNA, rRNA, ddDNA ) during RT-PCR.

Explicação

Questão 44 de 100

1

What are the steps of RT-PCR in the correct order?

❌
❌
❌
❌--Use cDNA in PCR

Arraste e solte para completar o texto.

Isolate Poly(A)-mRNA

Anneal Poly(dT) Primer to mRNA

Reverse Transcriptase Synthesis of cDNA

Remove RNA

Explicação

Questão 45 de 100

1

Electrophoresis is...

Selecione uma das seguintes:

the separation of molecules using an electric field
the separation of molecules using a magnetic field
the visualization of molecules using an electric field
the visualization of molecules using a magnetic field

Explicação

Questão 46 de 100

1

The migration distance is primarily determined by the ___________ ratio

Selecione uma das seguintes:

charge:mass
charge:size
density:mass
density:size

Explicação

Questão 47 de 100

1

What is the primary reason we use a matrix in electrophoresis?

Selecione uma das seguintes:

It increases resolution of molecules with a similar charge:mass ratio
It decreases the time it takes to complete electrophoresis
It allows the charges from the positive and negative ends to traverse the entire mechanism
It gives the molecules something to adhere to

Explicação

Questão 48 de 100

1

A matrix imposes a size constraint on molecule movement during electrophoresis

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 49 de 100

1

Select all that are common matrices for electrophoresis

Selecione uma ou mais das seguintes:

Agarose (AGE)
Polyacrylamide (PAGE)
Starch
Cellulose (TLE)
Silica (TLE)
Paper
Sodium hydrogen carbonate (SHC)

Explicação

Questão 50 de 100

1

Drag the types of electrophoresis to their applications

❌
- Proteins

Paper electrophoresis
- Small molecules

❌
- Small Molecules

❌
- Molecules dissolved in liquid

❌
- DNA (>2 kb)
- RNA (>2 kb)

❌
- DNA
- RNA
-Proteins
- Small molecules

❌ (PAGE)
- Small DNAs (<2 kb)
- Small RNAs (<2 kb)

Arraste e solte para completar o texto.

Starch gel electrophoresis

Thin-layer electrophoresis (TLE)

Free-flow electrophoresis

Agarose gel electrophoresis (AGE)

Capillary electrophoresis

Polyacrylamide gel electrophoresis

Explicação

Questão 51 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

For nucleic acid gel electrophoresis (separation of DNA and RNA), an ( agarose, polyacrylamide ) matrix is used for general applications while ( polyacrylamide, agarose ) is used for sequencing and footprinting.

Explicação

Questão 52 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

The phosphate in a nucleic acid's backbone has a strong ( negative, positive ) charge proportional to the ( number of base pairs (bp), size of base pairs (bp), proportion of bases (A/G/T/C) ), so it runs towards the ( positive, negative ) end of the electrophoresis matrix.

Explicação

Questão 53 de 100

1

Why is denaturing part of agarose electrophoresis?

Selecione uma das seguintes:

Used to prevent the formation of secondary structure
Used to prevent the formation of tertiary structure
Used to prevent re-annealing
Used to prevent annealing

Explicação

Questão 54 de 100

1

Which of the following is used in denaturing agarose gels (DNA)

Selecione uma ou mais das seguintes:

alkaline buffers
formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide
Detergents (e.g. SDS)

Explicação

Questão 55 de 100

1

Which of the following is used in denaturing agarose gels (RNA)

Selecione uma ou mais das seguintes:

formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide
alkaline buffers
Detergents (e.g. SDS)

Explicação

Questão 56 de 100

1

Which of the following is used in denaturing acrylamide gels?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Detergents (e.g. SDS)
alkaline buffers
formamide
formaldehyde
methylmercuric hydroxide

Explicação

Questão 57 de 100

1

Polyacrylamide gels permit the resolution of individual bases

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 58 de 100

1

Pulsed-field electrophoresis (or orthogonal field electrophoresis) does not permit the separation of large DNAs.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 59 de 100

1

Which of the following applies to pulsed-field electrophoresis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

effectively separates small chromosomes >10^6 bp
uses electric field conducted through a stiff rod snaking through the gel
one can alter the orientation of the field
effectively separates large chromosomes <10^10 bp
uses electric field conducted through a liquid phase via two small rods on either end (one cathode, one anode)
the field is fixed and can only go in one direction

Explicação

Questão 60 de 100

1

Which of the following are general stains for nucleic acids?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Ethidium bromide (EtBr)
SYBRgreen
Psorelen
Methylene blue

Explicação

Questão 61 de 100

1

During electrophoresis staining of nucleic acids, the stain intercalates between the ___________ of the nucleic acids.

Selecione uma das seguintes:

bases
phosphodiester bonds
-OH bonds

Explicação

Questão 62 de 100

1

Selecione da lista do Menu para completar o texto.

Alignment of stain molecules to DNA after electrophoresis permits a strong fluorescent signal when stimulated with ( UV, gamma radiation, an electric field ).

Explicação

Questão 63 de 100

1

Proteins are typically separated by what kind of electrophoresis?

Selecione uma das seguintes:

Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE)
Agarose gel electrophoresis (AGE)
Capillary electrophoresis
Free-flow electrophoresis

Explicação

Questão 64 de 100

1

PAGE gels can come in what formats?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Slab gels
Rod (tube) gels
Box gels

Explicação

Questão 65 de 100

1

Selecione da lista do Menu para completar o texto.

PAGE buffer systems can either be ( continuous or discontinuous, high or low charge, long or short, simple or complex ).

Explicação

Questão 66 de 100

1

Which of the following are components of a polyacrylamide gel?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Acrylamide
BIs-acrylamide
Buffer
Denaturants (optional)
Agarose

Explicação

Questão 67 de 100

1

Which of the following are catalysts used for polymerization of PAGE preparation?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Ammonium persulfate (APS)
N,N,N'N'-Tetramethylenediamine (TEMED)
Bis-acrylamide
Acrylamide

Explicação

Questão 68 de 100

1

What are the functions of the catalysts used during PAGE preparation?

Selecione uma das seguintes:

TEMED forms free radicals from APS
APS forms free radicals from TEMED
Bis-acrylamide forms free radicals from acrylamide
Acrylamide forms free radicals from bis-acrylamide

Explicação

Questão 69 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

In PAGE gel preparation the free radicals made from the catalysts form form linkages from ( acylamide, TEMED, APS ) to acrylamide and ( acrylamide, TEMED, APS ) to ( bis-acrylamide, TEMED, APS ).

Explicação

Questão 70 de 100

1

Which of the following can inhibit APS/TEMED catalysts during PAGE gel preparation?

Selecione uma ou mais das seguintes:

low pH
oxygen
high pH
water

Explicação

Questão 71 de 100

1

Select all that apply to %T

Selecione uma ou mais das seguintes:

= Total acrylamides in gel (w/v)
= % Acrylamide + % Bis-acrylamide
Increased %T --> decreased pore size
= Cross-linkers in gel (w/v)
= % Bis-acrylamide
Increased %T --> increased pore size

Explicação

Questão 72 de 100

1

Select all that apply to %C

Selecione uma ou mais das seguintes:

= Cross-linkers in gel (w/v)
= % Bis-acrylamide
Increased %C --> decreased pore size
= Total acrylamides in gel (w/v)
= % Acrylamide + % BIs-acrylamide
Increased %C --> increased pore size

Explicação

Questão 73 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

In a discontinuous buffer system...

Velocity of Migration = ( Effective Mobility, Size ) x ( Voltage, Mass )
- Proportion of charged molecules determines effective mobility

Voltage = ( Current, Charge ) x ( Resistance, Reactability )
- V = I x R

Proteins accumulate in a ( narrow, wide ) band (i.e. ( Stack, Resolution )) before entering the ( resolving, stacking ) gel

Stacking gels have ( large, small ) pores (( low, high ) %T, ( no molecular sieving, molecular sieving )) and a pH of ( 6.8, 8.8, 8.6, 6.6 ).
Glycine is ( protonated, deprotonated, differentially deprotonated ), so it has a ( slow, fast, intermediate ) migration and is the ( trailing, leading ) ion. Proteins are ( differentially deprotonated, protonated, deprotonated ), so they have an ( intermediate, slow, fast ) migration. Chloride (Cl-) has ( high, low ) mobility and is the ( leading, trailing ) ion.

Cl- moves ( away from, towards ) the glycine, creating a ( low, high ) conductivity zone. The ( low, high ) conductivity zone attains a ( higher, lower ) voltage gradient. At its steady-state, glycine and Cl- are moving at ( the same rate, different rates ) with a ( sharp, undefined ) boundary between them. As the glycine moves through the stacking gel, the ( Cl-, proteins )overtakes the ( proteins, Cl- ) ( in front of, behind ) the boundary. Proteins have ( higher, lower ) mobility than glycine in the trailing ( high-voltage, low-voltage ) gradient, so they move ( at, behind, in front of ) the boundary.

Resolving gels have ( smaller, larger ) pores (( higher, lower ) %T, ( molecular sieving, no molecular sieving )) and a pH of ( 8.8, 6.8, 6.6, 8.6 ). At the resolving gel, glycine ( deprotonates, protonates ) and ( increases, decreases ) mobility. The ( glycine, proteins ) overtakes the ( proteins, glycine ) and moves just behind the Cl-. Then the Proteins separate based on their ( charge:mass ratio, mass ) and molecular sieving due to gel composition (%T, %C).

Explicação

Questão 74 de 100

1

Denaturing protein electrophoresis is generally conducted using _________ to separate proteins.

Selecione uma das seguintes:

SDS-PAGE
Urea gels
Starch gels
Sucrose gels

Explicação

Questão 75 de 100

1

The "SDS" in SDS-PAGE stands for...

Selecione uma das seguintes:

sodium dodecylsulfate
sodium dioxycarbonate
sodium dioxysulfate
sodium dodecylcarbonate

Explicação

Questão 76 de 100

1

Select all that apply to the SDS detergent used in SDS-PAGE

Selecione uma ou mais das seguintes:

Linearizes protein
Coats protein with negative charges
Coats protein with positive charges
Compresses protein

Explicação

Questão 77 de 100

1

SDS-PAGE requires __________ for complete disruption of secondary structure

Selecione uma das seguintes:

a reducing agent
a buffer
a catalyst

Explicação

Questão 78 de 100

1

Which of the following are examples of reducing agents used during SDS-PAGE?

Selecione uma ou mais das seguintes:

beta-Mercaptoethanol (BME)
Dithiothreitol (DTT)
Dithioerythritol (DTE)
Sodium dodecylsulfate
Ampholytes

Explicação

Questão 79 de 100

1

Selecione da lista do Menu para completar o texto.

When using an SDS detergent for PAGE...

Separation is based on ( chain length, chain linearization, chain charge )
It has a slightly negative charge at pH 7, so the molecules run towards the positive pole

Explicação

Questão 80 de 100

1

Which of the following applies to Urea gels during denaturing protein electrophoresis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Disrupts hydrogen bonds (H-bonds) to for primary structure
Does not alter charges on protein for the given buffer system and pH
Separation is based on the charge:mass ratio
Alters charges on protein for the given buffer system and pH
Creates hydrogen bonds (H-bonds) for secondary structure
Separation is based on the chain length
Sometimes used for 1st dimension of 2D-PAGE

Explicação

Questão 81 de 100

1

Which of the following are examples of gel matrices used for non-denaturing protein electrophoresis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

polyacrylamide
starch
Sucrose
Glucose

Explicação

Questão 82 de 100

1

Which of the following are examples of native gels used for non-denaturing protein electrophoresis?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Sucrose
Glucose
Polyacrylamide
Starch

Explicação

Questão 83 de 100

1

Select all that apply to native gels

Selecione uma ou mais das seguintes:

Separation by charge:mass ratio
Maintain protein activity
Halt/dampen protein activity
Separation by chain length

Explicação

Questão 84 de 100

1

Select all that apply to isoelectrofocussing (IEF) gels

Selecione uma ou mais das seguintes:

Separation based on pI of protein
Ampholytes generate pH gradient
Proteins migrate to isoelectric point
Used during non-denaturing protein electrophoresis
Used during denaturing protein electrophoresis
Separation based on charge:mass ratio
Glycine and Cl- generate charge gradient

Explicação

Questão 85 de 100

1

Which of the following are examples of protein stains? (Drag to correct spot)

Standard: ❌
❌
Most sensitive: ❌

Arraste e solte para completar o texto.

Coomassie Brilliant Blue

Methylene Blue

Ruby Red

Sybergreen

Silver

Explicação

Questão 86 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

( Protein stains, Autoradiography ) (is/are) used for total protein visualization in electrophoresis (steady-state).

( Autoradiography, Protein stains ) (is/are) used for visualizing newly synthesized proteins after electrophoresis.

Explicação

Questão 87 de 100

1

Select all that apply to Autoradiography

Selecione uma ou mais das seguintes:

Used for In vivo labeling
Visualizes bands with x-ray film
Intensifying screens
increased spot density means increased quantity in band
Increased spot density means decreased quantity in band
Visualizes bands with UV light

Explicação

Questão 88 de 100

1

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

Rf = Distance of ( Migrated Band, Migrated Dye ) / Distance of ( Migrated Dye, Migrated Band )

Explicação

Questão 89 de 100

1

Migration in SDS-PAGE should be determined with a _________ function

Selecione uma das seguintes:

linear
logarithmic

Explicação

Questão 90 de 100

1

Rf is typically used when molecular weight markers (MWM's) run on the gel with the sample.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 91 de 100

1

2D enhanses esolution over 1D PAGE.

Selecione uma das opções:

VERDADEIRO
FALSO

Explicação

Questão 92 de 100

1

Why do we use 2-Dimensional Gel Electrophoresis?

Selecione uma das seguintes:

A 1D band may contain several proteins, so 2D resolves overlying proteins.
1D just seemed so boring that we had to add another dimension. It is the 21st century, after all.
1D band only transports the proteins halfway; 2D is needed for the proteins to travel the rest of the gel.

Explicação

Questão 93 de 100

1

Select all that apply to protein separation in the first dimension (electrophoresis).

Selecione uma ou mais das seguintes:

IEF or native gel
separation based on charge:mass ratio
ampholytes generate pH gradient
proteins migrate to isoelectric point
separate on SDS-PAGE gels
separation based on size
posttranslational modifications occur

Explicação

Questão 94 de 100

1

Select all that apply to protein separation in the second dimension (electrophoresis).

Selecione uma ou mais das seguintes:

separate on SDS-PAGE gels
separation based on size
Look for reproducible results
Posttranslational modifications occur
IEF or native gel
Separation based on charge:mass ratio
Proteins migrate to isoelectric point

Explicação

Questão 95 de 100

1

Why do posttranslational modifications occur after separation in the second dimension (electrophoresis)>

Selecione uma das seguintes:

ARG & mature spot may not be the same
proteins don't follow the laws of physics during electrophoresis
proteins migrate to the isoelectric point, not based on size

Explicação

Questão 96 de 100

1

Select all components of In vitro translation systems (electrophoresis)

Selecione uma ou mais das seguintes:

ribosomes
protein synthesis factors
tRNAs
mRNA
Amino acids (one radiolabeled)
rRNA
cDNA
Ampholytes

Explicação

Questão 97 de 100

1

What are the uses of In vitro translation of proteins?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Analyze major mRNAs present
Pro-protein production
Resolves overlying proteins

Explicação

Questão 98 de 100

1

What is the basic procedure of In vitro translation of proteins?

1. ❌
2. ❌

Arraste e solte para completar o texto.

Extract mRNAs

Copy mRNAs

Translate mRNAs In vitro

Label mRNAs In vitro

Explicação

Questão 99 de 100

1

___________ is the transfer of macromolecules from gel to membrane filter following electrophoresis.

Selecione uma das seguintes:

Blotting
Translation
Visualization
Staining

Explicação

Questão 100 de 100

1

What are some of the advantages of analyzing macromolecules using probes instead of in gels?

Selecione uma ou mais das seguintes:

More sensitive detection
Need less DNA/RNA/protein to complete
Probe detects only molecule of interest (not all molecules on gel visualized)
Reduce volumes of expensive reagents
Probes make you feel like a cool alien
Faster visualization

	Criado por Jo O'Bar aproximadamente 3 anos atrás

Covering Polymerase Chain Reaction, Electrophoresis, and more

Contemporary Lab Skills - Exam 2

Questão 1 de 100

What does PCR stand for?

Selecione uma das seguintes:

Explicação

Questão 2 de 100

Selecione da lista do Menu para completar o texto.

PCR is typically the first second third last( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

Explicação

Questão 3 de 100

What is the main significance of PCR vs other methods?

Selecione uma das seguintes:

Explicação

Questão 4 de 100

PCR amplifies all included DNA segments, which allows us to measure general information about the DNA, such as length and total composition.

Selecione uma das opções:

Explicação

Questão 5 de 100

What determines the segment of DNA that is amplified by PCR?

Selecione uma das seguintes:

Explicação

Questão 6 de 100

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

DNA amplification after PCR is less greater( less, greater ) than 10^6 5 10 12( 6, 5, 10, 12 )x

Explicação

Questão 7 de 100

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

PCR amplification requires little a large amount of( little, a large amount of ) template DNA, but is highly susceptible resistant( susceptible, resistant ) to contamination.

Explicação

Questão 8 de 100

______________ is a thermostable DNA polymerase used to automate the repetitive steps in the polymerase chain reaction (PCR) technique.

Selecione uma das seguintes:

Explicação

Questão 9 de 100

Which of the following is a requirement of PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 10 de 100

What kind of primers are used in PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 11 de 100

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

Explicação

Questão 12 de 100

Selecione das listas do Menu para completar o texto.

Explicação

Questão 13 de 100

Select all that apply to DNA polymerases for PCR

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 14 de 100

Arraste e solte para completar o texto.

Explicação

Questão 15 de 100

How long are typical PCR primers?

Selecione uma das seguintes:

Explicação

Questão 16 de 100

Select all that apply to a good PCR primer

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 17 de 100

Using software such as Oligo and Primer to calculate precise times and temperatures for PCR primer is an option, but calculations made by the researcher should be accurate enough.

Selecione uma das opções:

Explicação

Questão 18 de 100

Which of the following are major components in a PCR reaction mixture?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 19 de 100

Which of the following should be considered when choosing a buffer for PCR?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 20 de 100

The PCR cycle has which three steps?

Selecione uma ou mais das seguintes:

Explicação

Questão 21 de 100

PCR is typically the ( first, second, third, last ) step in DNA analysis.

DNA amplification after PCR is ( less, greater ) than 10^( 6, 5, 10, 12 )x

PCR amplification requires ( little, a large amount of ) template DNA, but is highly ( susceptible, resistant ) to contamination.

In PCR, "RAPD" stands for...

( Rapid, Renentive ) ( Amplification, Annealing ) of ( Polymorphic, Phosphodiester ) DNA