La deserción escolar conlleva a diferentes consecuencias que, en gran medida, afectan tanto al estudiante, su familia y contexto social. Entre las consecuencias que más destacan se pueden mencionar las siguientes:

Afectar de manera negativa el continuo desarrollo del capital humano de un país.
Conseguir empleos que ofrecen salarios bajos o insuficientes para cubrir sus necesidades básicas.
Generar altos costos sociales porque el capital humano es menos calificado.
Propiciar la desigualdad social.
Tendencia a incrementar los índices delictivos.
Puede conllevar a depresiones y frustraciones personales por no haber culminado sus estudios o carrera profesional.
Incrementar la posibilidad de realizar trabajos de manera incorrecta.
Aumentar el índice de las personas que dependen de las beneficencias del Estado.
Limitar el desarrollo económico y social de los países.