Ferramenta

Ferramenta

1. Web (Databases)

   • NCBI
     • SmartBLAST
       • Alinhamento comparativo das sequências primárias das proteínas de interesse com as proteínas depositadas nas bases de dados, a fim de identificar homologia.
     • blastp
   • EMBL
     • FASTA
     • Clustal Omega
       • Alinhamento Múltiplo de Sequências
         • Comparação das sequências das proteínas estudadas com as mesmas proteínas de organismos modelo (que são bem caracterizadas), a fim de identificar relações evolutivas entre essas espécies.
       • Elaboração de Árvore Filogenética
         • Representação gráfica das relações evolutivas entre a espécie estudada e organismos modelo.
         • Pretensão de demonstrar as modificações sofridas pelas proteínas ao longo do processo evolutivo.

2. Desktop

   • BioEdit
     • Visualização e Análise de Sequências
     • Comparação das sequências. Contagem de mismatches e gaps. Análise de estatísticas.