Dados Biológicos

Dados Biológicos

1. www

   • acesso livre
     • universal
       • intercomunicação

2. Bases de dados de Bioinformática

   • literatura
     • Ex.PubMed
   • BD Primárias
     • de sequências
       • DNA
         • Genoma
           • Ex. ENSEMBL
             • Genome
         • Nucleótidos
           • transcritos
             • Genes
               • CNV
               • SNV
           • Ex. ENA
             • GenBank
               • DDBJ
                 • INSDC - International Nucleotide Sequence
       • Proteínas
         • Ex. UNIPROT
           • GenPept
             • RSCB - PDB
               • WorlWide PDB
               • PTM
               • RPPA
     • Gene Expression
       • GEO
         • Single cell
       • Microarray
   • BD Integradas
     • Ex Gencards (genes Humanos)
       • Entrez
         • ClinPGx
           • KEEG

3. Plataformas Web

   • Kaggle
     • gitHub
   • TCGA
     • The Cancer Genome Atlas Program
   • BioData.pt
     • Portugal
   • other...

4. Dados Biológicos massivos

5. BigData

   • Volume
   • Velocidade
   • Variedade
   • Veracidade
   • Valor
   • Validade
   • Variabilidade
   • Vulnerabilidade
   • Volatilidade
   • Visualização

6. Qualidade

   • 5C
     • Consistência
     • Completude
     • Credibilidade
     • aCtualidade
     • Correção
   • precisão
   • reproducibilidade
   • deteção e correção de erros
   • Validação

7. Formatos

   • sequências
     • String
     • Objeto
     • FastA
     • txt
     • CSV
   • CNV
     • CELL
     • TSV
   • BAM
     • Binary Alignment Map
   • VCF
     • Variant Call Format
   • MAF
     • Mutation Annotation Format