Estructura del ADN: nucleótidos y doble hélice

Bases>doble helice> Nucleosoma> Cromosoma

10 pb = vuelta completa y 34A

DNA: polimero de nucleótidos

• Nucleótido
  • Azúcar (ribosa> vía pentosas)
    • Monosacárido (pentosa)
      • Unidas al grupo fosfato por enlace fosfodiéster atomos 3' y 5'
      • C2' Endo
        • Separados es más estable
      • C1' Exo
      • C3' Endo
        • Menos estable hay impedimento estérico
    • Se une a 5'OH
  • Base nitrogenada (A,G, C y T)
    • Púricas
      • Adenina y guanosina
      • N9 hace enlace glicosidico
      • a.a> Gly,Asp y Glu
    • Pirimídicas
      • Cistidina, timidina y uracilo
      • N1 hace enlace glicosidico
      • a.a> Asp y Glu
  • Grupo fosfato
    • AMP, ADP y ATP
    • Carga negativa
      • impiden que el DNA se doble
        • Se repelen por carga>máx entropía
      • P se une a 5'OH o 3'OH de la ribosa
• Nucleosido
• Características
  • Doble hélice 22-26A° ancho y 3.4 de largo
    • Surco mayor ( 22 Å) y surco menor (12 Å) depende del azúcar 2 o 3 endo
      • El surco mayor interactúa con más moléculas

Bases nitrogenadas

• Puricas
  • Adeninas
  • Guanosina
• Pirimidicas
  • Cistidina
  • Timidina
  • Uracilo
• Grupo ceto-enol
  • adenina>amino
  • Guanina>ceto
  • Timina> 2 gpos ceto
  • Citosina> Gpo ceto y amino
  • Equilibrio cetoenolico> Eq amino-amino
• Unidas por ptes de H+
  • A la misma distancia y ambos anillos planos
    • Ptes débiles mayor fuerza cuando esta lineal
      • Uniones Watson - Crick
    • A=T ;G=C
• No rigidas> pqños movimientos
• anillos heterociclicos

Tipos de DNA

• Tipo A
  • Dextrógiro
    • cadena más ancha y corta
      • surco mayor: Estrecho y profundo
        • surco menor: amplio no profundo
          • Diámetro de hélice 2.55nm
            • Pb por vuelta:11
              • plegamiento del azúcar C3'Endo
                • Conformación enlace N-glucosídico Anti
• Tipo B
  • Dextrógiro
    • cadena amplia de profundidad media
      • Surco mayor: amplio profundidad media
        • surco menor: estrecho profundidad media
          • Diámetro de hélice 2. 37nm
            • Pb por vuelta: 10.4
              • plegamiento del azúcar C2'Endo
                • Conformación enlace N-glucosídico Anti
• Tipo Z
  • Levógiro
    • Cadena más estrecha y larga
      • Surco mayor: sin profundidad
        • surco menor: estrecho profundo
          • Diámetro de hélice 1.84 nm
            • Pb por vuelta:12
              • plegamiento del azúcarC2'-endo (pirimidinas) / E C3'-endo (purinas)
                • Conformación enlace N-glucosídico Anti (pirimidinas) / Syn (purinas)

Estructuras

• primaria
  • Secuencia de nt encadenados
• Secundaria
  • Doble hélice
    • Cadena doble levógira o dextrógira
      • Cadenas antiparalelas 3'OH> 5' y 5'OH>3'
  • Triplex, cruziforme y pasador
    • Triplex: T-A-T y G-C-C
      • pueden funcionar como sitios de regulación
    • DNA G: Guanidina asociada a otras
      • Establecen un anillo estable con un metal iónico en el centro
• Terciaria
  • Cómo se almacena el DNA en un espacio reducido
    • En eucariontes
      • Empaquetamiento en histonas
    • En procariontes
      • Se pliega como súper hélice
        • Circular asociada a proteínas
• Cuaternaria
  • Fibra de cromatina se enrolla con grosor de 300 Å
    • Nucleosoma: núcleo proteíco octámero de histonas
      • Cada octámero tiene 1.7 vueltas de DNA bicatenario
      • Forman solenoides que conforman los cromosomas