BIOINFORMATICA

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BIOINFORMATICA
  1. Es una de las ciencias con mayor proyección en la adquisición de conocimiento científico.tuvo sus inicios en los años 50
    1. la primera secuencia de un ácido nucleico pertenecía a un ARNt que descodifica un codón de alanina en Saccharomyces cerevisiae.
    2. tuvo su verdadero auge con la creación de las primeras bases de datos y el desarrollo de algoritmos computacionales diseñados para el análisis de secuencia.
      1. GenBank , EMBL , y Base de Datos de ADN de Japón ( DDBJ )
        1. Pocos años después de la creación del GenBank, se generaron sus versiones europea y asiática, conocidas como la base de datos EMBL (European Molecular Biology Laboratory) y DDBJ (DNA Data Bank of Japan) en 1981 y 1984,
          1. BLAST (Basic Local Alignment Tool) revolucionó completamente la exploración y búsqueda de secuencias biológicas en bases de datos
        2. Margaret Dayhoff creó la primera base de datos de secuencias biológicas, en la cual almacenó y puso a disposición de la comunidad científica todas las secuencias de ADN y proteínas descritas hasta la fecha.
          1. 1978 Margaret Dayhoff fue la encargada de generar la primera matriz de substitución de aminoácidos, denominada PAM (Point Accepted Mutation)
          2. el Protein Data Bank (PDB). Esta base de datos surgió inicialmente con el propósito de almacenar las estructuras proteicas determinadas por cristalografía de rayos X
            1. hoy en dia esta base tiene toda clase de macromoléculas conocidas: ADN, ARN (ARNm, ARNr y ARNt) y grandes complejos proteicos asociados con todo tipo de biomoléculas.
          3. En colombia existe un par de grupos de bioinformática que llevan investigación básica en biología computacional
            1. la bioinformática en Colombia tiene un escenario esperanzador gracias a las políticas científicas recientes adoptadas por el Gobierno colombiano
              1. el pobre desarrollo de la bioinformática en Colombia tiene factores adicionales de fondo. Dichos factores radican esencialmente en el déficit académico en cuanto a la enseñanza de la bioinformática
                1. En Colombia, en la actualidad no se ha desarrollado ningún programa sólido para la formación integral de bioinformáticos competentes
                  1. solo programas de maestría y doctorado de instituciones como la Universidad Nacional de Colombia y la Universidad de los Ande
                    1. gracias a la falta de programas de formación académica en bioinformática, no exista promoción de proyectos de investigación dirigidos a la resolución de problemas propios y que involucren un componente bioinformático directo y bien planificado, y que existan iniciativas de proyectos de investigación en el área
                2. los mayores avances en la bioinformática acontecieron con la generación de algoritmos matemáticos para el análisis de secuencias, así como también, la creación de las bases de datos y herramientas para el análisis de secuencias con un mayor impacto a nivel global.
                  1. El estudio publicado por Stephen Altschul y colaboradores se considera como el método computacional de mayor uso y la referencia literaria de mayor citación en la historia de la ciencia. un nuevo panorama en la investigación de la biología computacional se abrió gracias a
                    1. a infraestructura computacional lograda para almacenar y administrar datos
                      1. los avances tecnológicos que desde finales de los años 90 incrementaron sustancialmente el volumen de procesamiento de las muestras biológicas.
                        1. los modelos matemáticos diseñados para analizar e interpretar patrones biológicos
                        2. Con la creación del consorcio para la ejecución del proyecto de secuenciación del genoma humano (Human Genome, HUGO)
                          1. en 1993, se inició la era genómica. Siendo la decodificación del genoma humano un proyecto tan ambicioso, otros consorcios se hicieron con el logro de secuenciar los primeros genomas no virales
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