Diagnóstico molecular

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Microbiología (Bacterias) Mind Map on Diagnóstico molecular, created by ana.karen94 on 08/26/2013.

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Diagnóstico molecular
1 Ventajas
1.1 Seguridad
1.1.1 No requieren aislamiento del agente infeccioso y se pueden llevar a cabo en muestras o extractos fijados químicamente (inactivos)
1.2 Sensibilidad
1.2.1 Detectar muestras muy diluidas de ADN microbiano en un tejido, aunque el agente no esté replicando ni produciendo otros indicios de infección
1.3 Especificidad
1.3.1 Base: diferenciad de genotipo
2 Detección de material genético microbiano
2.1 Análisis electroforético del ADN y polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción
2.1.1 Características fundamentales: Estructura del genoma y secuencia genética
2.1.2 Enzimas de restricción
2.1.2.1 Reconocen secuencias concretas de ADN que tienen una estructura palindrómica
2.1.3 Polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (PLFR)
2.1.4 Electroforesis
2.1.4.1 Normal
2.1.4.2 En gel en campo pulsado
2.2 Sondas genéticas
2.2.1 Herramientas sensibles y específicas para detectar, localizar y cuantificar secuencias de ácidos nucleicos específicos en muestras clínicas
2.2.2 Síntesis a través de métodos químicos o por clonación de fragmentos genómicos específicos o de un genoma vírico completo en vectores bacterianos
2.2.3 Tratamientos térmicos o químicos - hibridación
2.2.4 Transferencia puntual
2.2.4.1 Pequeño volumen del extracto en un filtro de nitrocelulosa
2.2.5 Transferencia Southern
2.2.5.1 Transferencia del patrón de restricción por endonucleasas de restricción separado electroforéticamente a un filtro de nitrocelulosa. Hibridación de sonda ADN:ARN
2.2.6 Transferencia de Northern
2.2.6.1 ARN separado mediante electroforesis y fijado a un filtro de nitrocelulosa. Hibridación de sonda ARN:ADN
2.2.7 Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
2.2.7.1 Cebadores
2.2.7.2 Detección de retrovirus, herpes, papilomavirus y otros virus de ADN
2.2.8 PCR-TI (transcripción inversa)
2.2.8.1 Transcriptasa inversa de los retrovirus para convertir el ARN vírico o el ARN mensajero en ADN
2.2.9 Análisis con ADN de cadena ramificada
2.2.9.1 Cuantificar concentraciones plasmáticas de ARN del VIH
3 Detección de proteínas
3.1 Detección de act. enzimática de transcriptasa inversa en suero o cultivo celular indica presencia de retrovirus
3.2 Patrón proteico de un virus u otro agente formado tras la electroforesis con dodecil sulfato sódico en gel de poliacrilamida (DSS-GEPA) también se puede utilizar para identificar y distinguir diferentes cepas víricas o bacterianas