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Estructura proteínas

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Resource summary

Estructura proteínas
  1. primaria
    1. reactivo de Edman: PITC (isotiocianato de fenilo)
      1. reacción con grupo N terminal
        1. desacoplo: a.a PTH
          1. cada a.a un aminoácido PTH diferente (sustituyente diferente)
        2. no determinar toda estructura primaria
          1. interferencia con productos secundarios
          2. sequenator: instrumento que hace 50 degradaciones Edman sucesivas
          3. Identificación a.a N-temrinal
            1. hidrólisis proteína con ácido diluido
              1. hidrólisis parcial (algunos enlaces peptídicos)
              2. separación y determinación mediante electroforesis o analizador de a.a
                1. a.a C-terminal a identificar con carboxipeptidasa
                  1. peptidasa: cataliza hidrólisis de enlace peptidico
                    1. no en arginina o lisina
                      1. tripsina y quimotripsina: hidrólisis enlaces peptidicos especificos
                        1. tripsina
                          1. hidrólisis de 3 enlaces peptidicos
                            1. formación hexapéptido, dipéptido, y dos tripéptidos
                          2. quimotripsina
                            1. hidrólisis enlaces peptidicos en lado C de a.a con anillos aromáticos de seis miembros (Phe, Tir, Trp)
                        2. no hidrólisis si prolina en sitio de hidrólisis
                          1. forma tridimensional no reconocible
                          2. Bromuro de cianógeno
                            1. hidrólisis enlace peptidico en lado C de un residuo de metionina
                              1. ruptura si prolina en sitio de ruptura
                                1. mecanismo
                                  1. ataque del azufre altamente nicleofílico de la metionina sobre el bromuro
                                    1. hidrólisis catalizada por ácido de la imina
                                      1. formación de un anillo de 5 miembros con salida del grupo saliente básicamente débil
                              2. Secundaria
                                1. conformaciones repetidas que asumen segmentos de la cadena
                                  1. pliegos de los segmentos de la columna vertebral
                                  2. conformaciones estabilizadas mediante puente hidrógeno entre grupos peptidicos
                                    1. hélice alfa
                                      1. columna vertebral se enrolla alrededor de eje largo de la molécula
                                        1. sustituyentes de los carbono alfa proyectados hacia fuera
                                          1. minimización impedimento estérico
                                          2. H unido a N amiduro se enlaza a un oxígeno carbonilo de un aa alejado de 4 aa
                                            1. puente hidrógeno entre uno enlazado a un N y un par de electrones no comportidos del O
                                          3. hoja plegada beta
                                            1. columna vertebral extendida en una estructura con forma de zigzag
                                              1. puente hidrógeno entre cadenas peptidicas adyacentes
                                                1. sustituyentes cerca: formación puentes hidrogeno si pequeños R
                                              2. terciaria
                                                1. disposición tridimensional de átomos
                                                  1. plegamiento espontáneo cuando está en solución
                                                    1. mayor estabilidad
                                                      1. interacción establizadora: liberación energía
                                                        1. incluyendo puentes disulfuro, puentes hidrógeno y atracciones electrostáticas y interacciones hidrofóbicas
                                                          1. entre grupos petidicos y sustituyentes alfa
                                                        2. más energía liberada, más estable
                                                      2. proteínas sobretodo en ambientes acuosos: exposición máxima de grupos no polares (ocultados lejos del agua)
                                                      3. cuaternaria
                                                        1. más de una cadena peptidica
                                                          1. subunidades (cadenas individuales)
                                                            1. unidas por: interacciones idrofóbicas, puentes hidrógeno y atracciones electrostáticas
                                                            2. descripción subunidades en el espacio
                                                            3. Desnaturalización proteínas
                                                              1. destrucción estructura terciaria
                                                                1. rompimiento enlace que mantiene forma tridimensional
                                                                  1. desnaturalización
                                                                2. Formas
                                                                  1. cambios de pH (modificación cargas): interferencia con atracciones electrostáticas y los puentes hidrógeno
                                                                    1. ciertos reactivos (urea): formación puentes hidrógeno en grupos proteicos
                                                                      1. solventes orgánicos: interferencia con interacciones hidrofóbicas
                                                                        1. calor o agitación: aumento del movimiento molecular entonces interferencia en fuerzas de atracción
                                                                      2. plegamiento de proteínas
                                                                        1. problema de existencia de macromoléculas en la célula
                                                                          1. interacciones no deseadas con proteínas
                                                                          2. CHAPERONAS MOLECULARES
                                                                            1. proteína llamada acompañante molecular
                                                                              1. chaperoninas: agregados macromoleculares (compuesto de proteinas de masomenos 60kDa)
                                                                                1. oligoméricas, cilindro de uno o dos anilos espalda contra espalda
                                                                                  1. cada anillo tiene una cavidad donde se produce plegamiento
                                                                                  2. GRUPO 1
                                                                                    1. encontradas en eubacterias y orgánulos de organismos eucarióticos
                                                                                      1. cilindro compuesto por uno o dos anillos heptaméricos
                                                                                        1. GroEL
                                                                                          1. proteína esencial para viabilidad de la bacteria
                                                                                            1. 10 % proteinas celulares interaccionas con GroEL
                                                                                              1. homología con proteinas de peso similar e involucradas en mecanismos de defensa
                                                                                                1. incubación chaperonina
                                                                                                  1. ensayo de actividad funcional àra comprobar grado de renaturalización
                                                                                                    1. cofactores
                                                                                                      1. oligómero formado por 7 subunidades de una proteina: GroES
                                                                                                        1. unión a boca de anillo GroOEL
                                                                                                          1. GroEs estructura
                                                                                                            1. monómero con estructura barril de laminas beta
                                                                                                              1. lazo desordenado interacciona con dominio apical de GroEL
                                                                                                            2. ATP (unión e hidrólisis)
                                                                                                        2. Estructura
                                                                                                          1. 3 dominios
                                                                                                            1. ecuatorial
                                                                                                              1. interacciones general aniñño heptamérico
                                                                                                                1. acogida ATP
                                                                                                                2. apical
                                                                                                                  1. entrada cavidad de anillo
                                                                                                                    1. residuos hidrofóbicos
                                                                                                                    2. intermedio
                                                                                                                      1. transmisor de señales entre otros dos dominios
                                                                                                                        1. bisagra para trasladar cambios conformacionales
                                                                                                                  2. Mecanismo funcional
                                                                                                                    1. residuos hidrofóbicos como imanes (uniones de todos los residuos)
                                                                                                                      1. ATP se una a sitio de unión: dominio ecuatorial
                                                                                                                        1. resto de mónomeros del anillo unen ATP: cooperatividad positiva
                                                                                                                          1. coopertividad negativa: otras 6 subunidades tienen impedimento de unióna las 7 del otro anillo
                                                                                                                            1. señal desde dominio ecuatorial a través del intermedio hasta el apical: cambio conformacional: unión cochaperonina GroES
                                                                                                                        2. unión GroES levanta dominios apicales (puntas), sella cavidad
                                                                                                                          1. residuos hidrofóbicos interactuan con GroEs: exposición residuos en superficie interior de la cavidad
                                                                                                                            1. desaparición y aparición residuos hidrofílicos
                                                                                                                          2. hidrólisis moléculas de ATP, relajan unión GroEs y GroEL, señal para unión de ATP en otro anillo
                                                                                                                            1. otra molécula de GroEs se una a segundo anillo: complejo simétrico
                                                                                                                            2. formación complejo simétrico no muy estable
                                                                                                                              1. unión GroEs a segundo anillo: liberación de cochaperonina en el primero
                                                                                                                                1. salida del polipeptido
                                                                                                                            3. GroEl y chaperoninas no enzimas: alcanzar estructura nativa
                                                                                                                              1. mecanismo GroEL: genera gasto continuo de ATP
                                                                                                                                1. ayuda en replegar proteina de peso molecular inferior a 50kDa
                                                                                                                                2. chaperoninas tipo I: proteinas de choque térmico
                                                                                                                              2. GRUPO II
                                                                                                                                1. en arqueobacterias y en citoplasma de organismos eucarióticos
                                                                                                                                  1. variables en grado de oligomerización, número de subunidades (distintas)
                                                                                                                                    1. CTT
                                                                                                                                      1. chaperonina citoplasmática de eucariotas
                                                                                                                                        1. 8 subunidades distintas (homólogas)
                                                                                                                                          1. plegamiento actinas y tubulinas: proteinas citoesqueleticas
                                                                                                                                            1. interacciones entre residuos especificos
                                                                                                                                              1. conformación cuasi nativa con actina
                                                                                                                                                1. tubulina: proteina compleja
                                                                                                                                                  1. formación microtúbulos (fenómeno de polimerización)
                                                                                                                                                2. dominios: ecuatorial, intermedio y apical
                                                                                                                                                  1. cerrar cavidad mediante otro dominio
                                                                                                                                                  2. conformación abierta (ausencia de ATP) Unión ATP da conformación cerrada
                                                                                                                                        Show full summary Hide full summary

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                                                                                                                                        T9. Enfermedades Inflamatorias
                                                                                                                                        Vivi Riquero
                                                                                                                                        Definiciones CARDIOLOGÍA
                                                                                                                                        Vivi Riquero
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                                                                                                                                        Fichas para oposiciones de auxiliar de enfermería
                                                                                                                                        leyvamiri
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                                                                                                                                        Infecciones Quirúrgicas
                                                                                                                                        Exero
                                                                                                                                        Tema 15: Características del sistema respiratorio
                                                                                                                                        Marlopcar López
                                                                                                                                        FUNDAMENTOS DE LA EMBRIOLOGÍA.
                                                                                                                                        fperezartiles
                                                                                                                                        Alergología - Práctica para el ENARM
                                                                                                                                        Emilio Alonsooo