Biosintesis de macromoléculas

Raul Jimenez1622
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Resource summary

Biosintesis de macromoléculas
1 Replicación el ADN. Coordinación de la replicación con el ciclo celular
1.1 Ácido dexosirribonucleico
1.1.1 Bases púricas
1.1.2 Bases pirimidínicas
1.1.3 Doble hélice
1.1.3.1 Difracción de rayos X
1.1.3.1.1 James D. Watson y Francis Crick
1.1.3.2 0.34 nm entre bases
1.1.3.3 Gira a derechas (ADN B)
1.1.3.4 Surco mayor
1.1.3.4.1 Unión fago lambda
1.1.3.5 Surco menor
1.2 Replicación semiconservativa
1.2.1 Procariota
1.2.1.1 exonucleasas
1.2.1.2 Polimerasa I, II, III, IV, V
1.2.1.3 1 origen replicación
1.2.1.4 No complejo proteínas unidas al ADN
1.2.2 Eucariota
1.2.2.1 Histonas
1.2.2.2 polimerasas α, β, γ, δ, ε
1.2.2.3 Muchos orígenes replicación
1.2.2.4 Telomerasa
1.2.2.5 Retrotransposón
1.2.3 Iniciación
1.2.4 Elongación
1.2.5 Terminación
1.2.6 Replisoma
1.2.7 Procesos en cascada
1.3 Ciclo celular
1.3.1 G0
1.3.2 M
1.3.3 Interfase
1.3.3.1 G1
1.3.3.2 S
1.3.3.3 G2
1.3.3.4 Kinasas
1.3.3.5 oleadas de ciclinas
1.4 Modelos de regulación del origen de replicación del ADN
1.5 Ciclo celular, CDK y ciclinas
1.6 Replicación y ciclo celular de Toxoplasma gondii
1.7 Regulación de la replicación y chequeo de daños del ADN
2 Reparación del ADN. Implicaciones de la reparación en el ciclo celular
2.1 Reparación errónea
2.1.1 ADN mutado
2.2 Movimiento en zigzag de la polimerasa de ADN
2.3 Fotorreactivación
2.3.1 PRE
2.4 Desmetilación de guaninas
2.4.1 Enzima activa
2.4.2 Enzima inactiva
2.4.2.1 Tabaco
2.5 Desmetilación de adeninas y de citosinas
2.6 Reparación por escisión de base
2.6.1 Proceso cooperativo con reacciones en cascada
2.6.2 uracilo
2.6.3 8-oxoGuanina
2.7 Reparación por escisión denucleótidos
2.7.1 dímeros detimina
2.8 Reparación de desapareamientos en procariotas
2.9 Reparación dedesapareamientos eneucariotas
2.10 Reparación de roturas de cadena
2.11 Reparación de daños en ambas cadenas
2.11.1 Unión de extremos no homólogos
2.11.2 Unión de extremos microhomólogos
2.11.2.1 Genera inserciones
2.11.2.2 Genera deleciones
2.11.3 Recombinación homóloga en procariotas
2.11.4 Recombinación homóloga en eucariotas
2.11.5 Modelos de recombinación homóloga en eucariotas
2.11.5.1 DSBR
2.12 Tolerancia mediante síntesis translesión
2.12.1 Sustitución de polimerasa
2.12.2 Mutasoma de procariotas
2.12.3 Mecanismo propenso a error
2.13 Respuesta SOS
2.13.1 Supervivencia a costa de mayor probabilidad de mutaciones
2.14 Reparación del ADN y ciclo celular
2.15 Actividad autocorrectora de la polimerasa de ADN
2.16 Reparación de daños en una cadena
2.16.1 ARN polimerasa II
2.16.2 NT-SSB
3 Transcripción, procesamiento y maduración del ARN. Regulación de la transcripción
3.1 Dogma central de la biología molecular
3.1.1 ADN
3.1.1.1 ARN
3.1.1.1.1 Proteínas
3.2 Mayor complejidad en eucariotas que procariotas
3.3 Circuitos de control de la transcripción
3.3.1 Genes
3.3.1.1 Reprimen
3.3.1.2 Inducen
3.3.2 Enzimas
3.3.2.1 Activan
3.3.2.2 Inhiben
3.3.3 Control positivo
3.3.4 Control negativo
3.4 Transcripción procariotas
3.4.1 Iniciación
3.4.1.1 Factor sigma
3.4.2 Elongación
3.4.3 Terminación
3.4.3.1 Independiente de ro
3.4.3.2 Dependiente de ro
3.5 Regulación de la transcripción en procariotas
3.5.1 Operón lac
3.5.1.1 CAP
3.5.1.2 cAMP
3.5.2 Operón araBAD
3.5.3 Operón trp
3.5.3.1 Atenuación
3.6 Degradación del ARN procariotas
3.6.1 Gram +
3.6.2 Gram -
3.6.3 degradosoma
3.6.4 exosoma de arqueobacterias
3.7 Transcripción en eucariotas
3.7.1 Complejidad
3.7.2 7-metilguanosina
3.7.2.1 Protege ARNm
3.7.2.2 Regula traducción
3.7.3 Poliadenilación
3.7.4 Caperuza
3.7.5 Intrones
3.7.6 Ayustamiento
3.7.6.1 Mecanismos
3.7.7 Edición del ARNm
3.7.7.1 Apolipoproteína B
3.8 Regulación de la transcripción en eucariotas
3.8.1 dedos de zinc
3.8.2 cremalleras de leucina
3.8.3 hélice-lazo-hélice
3.8.4 Potenciadores
3.8.5 Factores de transcripción
3.8.5.1 Inactivos
3.8.5.2 Activos
3.8.6 Estructura del gen eucariota
3.8.7 Inicio
3.8.8 Elongación
3.8.9 Terminación
3.9 Degradación de ARN en eucariotas
3.9.1 ARN de interferencia
3.9.1.1 Piwi
3.10 Retotranscripción
3.10.1 Retrovirus
3.10.2 Transcriptasa reversa
3.11 Regulón SOS de respuesta de emergencia
4 Traducción, plegamiento, modificaciones postraduccionales, degradación de proteínas y su regulación
4.1 Código genético
4.1.1 Universal
4.1.2 Degenerado
4.1.3 Organizado en tripletes o codones
4.1.4 Descubrimiento
4.2 Procariota
4.2.1 30S
4.2.2 50S
4.2.3 ARNms policistrónicos
4.3 Eucariota
4.3.1 40S
4.3.2 60S
4.3.3 CAP
4.3.4 Poly A
4.3.5 reacciones en cascada
4.4 Plegamiento de proteínas
4.4.1 chaperoninas
4.4.1.1 Evitar agregación
4.4.1.2 sistema DnaK
4.4.1.3 Clasificación
4.4.1.4 sistema GroEL/GroES
4.4.2 Enfermedades
4.4.3 Energía libre de las conformaciones
4.4.4 Cotraduccional
4.4.5 Postraduccional
4.4.6 Chaperonas intramoleculares
4.4.7 Proceso conservado
4.4.8 Cooperativo
4.5 Traducción
4.5.1 Eucariota
4.5.1.1 Terminación
4.5.1.1.1 Factores de liberación
4.5.1.1.2 Costoso
4.5.1.2 Elongación
4.5.1.2.1 Factores de elongación
4.5.1.2.2 costoso
4.5.1.3 Inicio
4.5.1.3.1 Factores de inicio
4.5.1.3.2 UTR
4.5.1.3.3 costoso
4.5.1.3.4 dependiente de Cap y de IRES
4.5.1.4 Secuencia consenso de Kozak
4.5.1.5 Múltiples sitios de inicio
4.5.1.6 Polirribosoma
4.5.2 Procariota
4.5.2.1 Terminación
4.5.2.1.1 Costoso
4.5.2.2 Elongación
4.5.2.2.1 Factores de elongación
4.5.2.2.2 Costoso
4.5.2.3 Inició
4.5.2.3.1 Factores de inicio
4.5.2.3.2 Costoso
4.5.2.4 Secuencia consenso de Shine-Dalgarno
4.5.2.5 Polirribosoma
4.5.2.6 Secuencia consenso de Kozak
4.5.3 Activación de aminoácidos
4.5.4 ARN transferente
4.5.4.1 Estructura secundaria
4.5.4.2 Estructura primaria
4.6 Degradación de proteínas
4.6.1 Lisosomas
4.6.2 Proteosomas
4.6.3 Proteosoma y ciclo celular
4.6.3.1 Apoptosis
4.7 Modificaciones postraduccionales de proteínas
4.7.1 Prenilación
4.7.2 Glucosilación
4.7.3 Ubiquitinación
4.8 Traducción del lenguaje del ADN/ARN al de proteínas
5 Mecanismos moleculares del transporte de proteínas a diferentes estructuras y compartimentos celulares
5.1 Envueltas celulares de procariotas
5.1.1 Procariotas
5.1.1.1 Gram +
5.1.1.1.1 Peptidoglucano
5.1.1.2 GRam -
5.1.1.2.1 Peptidoglucano
5.1.1.2.2 Membrana
5.1.1.2.3 Glicocalix
5.1.2 Peptidoglucano
5.1.2.1 Resistencia
5.1.2.2 Flexibilidad
5.2 Transporte de proteínas en procariotas
5.2.1 Rutas de secreción y y de traslocación
5.2.2 Ruta Sec
5.2.2.1 Bacterias
5.2.2.1.1 Chaperonas
5.2.2.1.2 Peptidasa del péptido líder
5.2.2.1.3 Proceso costoso
5.2.3 Partícula de reconocimiento de señal
5.2.3.1 Rutas traslocación de argininas gemelas
5.2.3.1.1 Proteínas plegadas
5.2.3.2 Rutas de secreción
5.2.3.2.1 Proteínas desnaturalizadas
5.2.4 Ruta Tat
5.2.4.1 Gradiente de protones
5.2.4.2 Chaperonas
5.2.4.3 Cofactores
5.3 Sistemas de membranas en eucariotas
5.3.1 Célula animal
5.3.2 Célula vegetal
5.4 Transporte de proteínas en eucariotas
5.4.1 Transporte en mitocondrias
5.4.1.1 Acoplamiento del transporte y plegamiento asistido
5.4.2 Transporte en cloroplastos
5.4.2.1 Acoplamiento del transporte y plegamiento asistido
5.4.3 Inserción de proteínas de membrana
5.4.3.1 Con secuencia señal
5.4.3.2 Con secuencia de parada
5.4.4 Transporte entre el núcleo y el citoplasma
5.4.5 transporte de proteínas al retículo endoplásmico rugoso
5.4.6 Endosomas y vesículas de secreción
5.4.7 Flujos de membranas
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