A partir del ADN ocurren los procesos en el organismo

A partir del ADN ocurren los procesos en el organismo

1. Replicación del ADN

   • Descubrimiento de la estructura del ADN
     • Primera ley de Chargaff
       • Purinas con pirimidinas A-T, C-G
     • Watson y Crick
       • Distancia ente bases (0.34nm)
       • Estructura helicoidal
       • Distancia de repetición (3.4nm)
     • Rosalind Franklin
       • Cuasicristales de ADN
         • Disfracción de rayos X
     • Surco mayor y menor
     • ADN-A y ADN-B (giro a derechas) ADN-Z (giro a izquierdas)
     • ADN superenrollado
       • Nucleosoma (Histonas+hélice)
   • Cinco ADN polimerasas
     • 5' ->3'
     • Fragmentos de Okazaki
   • Semiconservativa
   • Iniciación, elongación y terminación
     • Replisomas y lazo en cremallera de replicón
     • Horquilla de replicación
       • Girada de ADN y proteínas de uniión a cadena sencilla
       • RFC, PCNA, RPA, FEN-1
     • Terminación con o sin telomerasa
   • Ciclo celular
     • G0; Interfase (G1, S, G2); M(mitosis)
     • Meiosis
     • Coordinación con la replicación
       • Procesos en cascada y activaciones mediante fosforilaciones
       • Quinasas y ciclinas

2. Reparación del ADN

   • ADN dañado cambia a ADN mutado por reparación errónea
     • Actividad autocorrectora de la ADN polimerada
   • Mutación del ADN
     • Permite la evolución
   • Reversión directa del daño
     • Fotorreactivación
     • Desmetilación de guaninas
     • Desmetilación de adeninas y citosinas
   • Reparación de daños en una cadena
     • Reparación por escisión de base
       • Mediante glucosilasa
     • Reparación por escisión de nucleótidos
     • Reparación de desapareamientos
       • En procariotas
         • Cadena mutada (desmetilada)
       • En eucariotas
         • Corte en 5' o 3'
     • Reparación de roturas de cadena
   • Reparación de daños en ambas cadenas
     • Unión de extremos no homólogos
     • Unión de extremos microhomólogos
       • Inserciones
       • Deleciones
     • Recombinación homóloga
       • Procariotas
         • RecBCD
       • Eucariotas
         • Reparación de cromosomas homólogos
         • Reparación de roturas de doble cadena
         • Modelo de unión doble de Holliday
         • Apareamiento de cadena dependiente de síntesis
   • Tolerancia mediante síntesis translesión
     • Polimerasas de ADN propensas a error
     • Supervivencia a costa de más mutaciones
   • Respuesta SOS
     • Reparación de emergencia propensa a error
   • Reparación y ciclo celular
     • Sobrecruzamiento de cromosomas
     • Recombinación homóloga
     • Quinasas dependientes de ciclinas
     • Puntos de control

3. Transcripción, procesamiento y maduración del ARN

   • Dogma central de la biología molecular
     • ADN
       • ARN
         • Proteínas
   • Retrotranscripción
     • Retrovirus
   • Más complejo en eucariotas que en procariotas
   • Circuitos de control de la transcripción
     • Negativo (represor)
     • Positivo (activador)
   • Transcripción
     • Porcariotas
       • Iniciación
         • Factor sigma
       • Elongación
         • ARN polimerasa
       • Terminación
         • Terminador
         • Dependiente o independiente de ro
       • Regulación
         • Operón lac (lactosa)
         • araBAD de arabinosa
         • Regulón SOS de respuesta de emergencia
         • Operón trp (triptófano)
     • Eucariotas
       • Caperuza 5'
       • Poliadenilación 3'
       • Genes interrumpidos por intrones
       • Ayustamiento
         • El ARN como enzima
       • Regulación
         • Potenciadores (enhancers)
         • Aisladores (insultors)
         • Proteínas del unión al ADN
           • Hélice-Giro-Hélice
           • Dedos de Zinc
           • Cremalleras de leucina
           • Hélice-Lazo-Hélice
         • Fcatores de transcripción
       • Inicio, elongación y terminación
   • Degradación del ARNm
     • Procariotas
       • CRISPR-Cas (Bacterias)
       • Degradosoma (Eubacterias)
       • Exosoma de arqueas
     • Eucariotas
       • Interferencia /Silenciamiento
       • Exosoma humano

4. Traducción de proteínas y procesos postraduccionales

   • Código genético
     • Lenguaje de ADN/ARN a proteínas
     • Severo Ochoa
   • Procariotas
     • Ribosomas 70S (30+50)
     • ARNm policintrónico
       • Se traducen varias proteínas al mismo tiempo
     • ARNm no madura
     • Traducción
       • Secuencia consenso de Shine-Dalgarno
       • Polirribosomas
   • Eucariotas
     • Ribosomas 80S (40+60)
     • ARNm monocistrónico
     • Maduración del ARNm
       • Cola poliA
       • Caperuza de 7-metilguanosina
     • Traducción
       • Activación de aminoácidos
       • Intervención de ARNt
       • Secuencia consenso de Kozak
       • Polirribosomas y múltiples sitios de inicio
   • Plegamiento de proteínas
     • Desnaturalización con urea/mercaptoetanol
     • Renaturalización tras diálisis
     • Chaperonas moleculas
       • Plegamiento cotraduccional
       • Hsp70
     • Espontáneo
     • Chaperoninas
       • Plegamiento postraduccional
       • Sistema GroEL/GroES (Hsp60/Hsp10)
   • Modificaciones postraduccionales (PTMs)
     • Prenilación
     • Glicosilación
     • Etiquetaje de péptidos
     • Oxidación
     • Simulación por ordenador
   • Degradación de proteínas
     • Lisosomas
       • Mezcla de enzimas hidrolíticas
     • Proteasomas
       • Marcaje
       • Captura y entrada
       • Digestión
       • Relación con el ciclo celular
         • Estrés
         • Supervivencia
         • Apoptosis
         • Senescencia
     • Procesos en cascada

5. Transporte de proteínas

   • Envueltas celulares
     • Procariotas
       • Peptidoglucano(mureína)
         • Biopelículas y comunicación por canales iónicos
           • Gram +
           • Gram -
   • En procariotas
     • Reconocimiento de señal
       • Ruta Sec
         • Dependiente o no de SRP
         • ATP como fuente de energía
       • Ruta Tat
         • Gradiente de protones como fuente de energía
   • Sistemas de membranas en eucariotas
     • Delimitan orgánulos y compartimentos
     • Por ellas se transportan sustancias
     • Inserción de proteínas de membrana
       • Péptidos con secuencia señal y de parada
       • Proteínas modificadas (fosforiladas, glucosiladas)
   • En eucariotas
     • Poros en la doble envuelta nuclear
       • Transporte entre núcleo y citoplasma
         • Proceso costoso con reacciones en cascada
         • Gasto de energía en forma de GTP y a veces ATP
     • Retículo endoplásmico rugoso(RER)
       • Síntesis, modificación y transporte de proteínas
       • Importación cotraduccional
         • Energía en GTP
       • Peroxisomas
     • Aparato de Golgi
       • Etiquetaje y empaquetamiento de proteínas
         • Provienen del RER
         • Endosomas y vesículas de secreción
           • Lisosomas
     • Flujos de membranas
       • Ap. Golgi y RER transporte bidireccional
       • Rreceptor de manosas 6P
       • Proteínas de membrana
         • Promueven el transporte de vesículas (clatrina)
     • Mitocondrias
       • Transporte y plegamiento asistido
       • Transferencia de electrones y cadena respiratoria para energía
       • Transporte matriz-espacio intermembrana
     • Cloroplastos
       • ATP como energía
       • Transporte y plegamiento asistido
       • Estroma y lumen de tilacoides
     • Citoesqueleto
       • Red de túbulos para el transporte
     • Nanomáquinas
       • Motores moleculares sintéticos

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