Criterios y métodos de clasificación de microorganismos

Criterios y métodos de clasificación de microorganismos

1. Características Morfológicas

   • Forma colonial, tamaño y forma de la célula, etc.
     • Tinciones
       • Gram
         • Revela la forma de la bacteria, agrupación y taxonomía
           • Gram Positivo
             • Retienen el cristal violeta
           • Gram negativo
             • Se decoloran y tiñen de rojo
       • Ziehl - Neelsen
         • Para bacterias ácido-alcohol-resistentes
           • Color rojo (BAAR)
             • Resistentes a la decoloración
           • Color azul
             • Bacterias suceptibles
       • Cápsula
         • La cápsula se tiñe de azul pálido
       • Schaeffer y Fulton
         • Esporas se tiñen de color verde
       • Flagelos
         • Flagelos de color rosa o rojo
       • Permite visualizar mejor las características de las células

2. Características ecológicas

   • Capacidad del microorganismo para colonizar un ambiente

3. Características fenotípicas

   • Morfología
   • Movilidad
     • No móvil
     • Movilidad por deslizamienot
     • Movilidad natatoria por flagelos
     • Enjambre (Swarming)
     • Vesículas gaseosas
   • Metabolismo
     • Mecanismo de conservación de energía
     • Utilización de compuestos carbono, nitrógeno o azufre
     • Fermentación de azúcares
     • Fijación de nitrógeno
   • Fisiología
     • Temperatura
     • pH
     • Sales para el crecimiento
     • Respuesta al oxígeno
     • Catalasa y oxidasa
     • Enzimas extracelulares
   • Química celular
     • ácidos grasos
     • lípidos polares
     • quinonas respiratorias
   • Otros aspectos
     • Pigmentos
     • luminiscencia
     • Sensibilidad a antibióticos

4. Características bioquímicas

   • Catalasa
     • Convierte el peróxido de hidrógeno en H2O y O2
   • Coagulasa
     • coagulación del plasma
   • Fermentación de carbohidratos
     • Se produce ácido y/o gas durante fermentación
   • Hidrólisis de caseína
     • Detecta presencia de caseinasa
   • Hidrólisis de lipidos
     • Detecta presencia de lipasa
   • Licuefacción de gelatina
     • Si puede producir proteasas
   • Oxidasa
     • Detecta presencia de citocromo oxidasa
   • Reducción de nitratos
     • Si usa nitrato como receptor de electrones
   • Sulfuro de hidrógeno
     • Detecta formación de H2S
   • Ureasa
     • Detecta la enzima que rompe la urea
   • Utilización de citrato
     • Se utiliza citrato como fuente de carbono

5. Características genotípicas

   • Hibridación DNA-DNA
     • Comparación de genomas
   • Huella genómica
     • Ribotipado
     • RFLP
     • rep-PCR
   • MLST
     • Tipado de cepas utilizando secuencias de DNA de múltiples genes
   • Contenido GC
     • Porcentaje de pares de bases de guaninas + citosinas en el genoma
   • Secuenciación de ácidos nucleicos
     • Secuencia del rRNA de la subunidad pequeña
   • Comparación de proteínas
     • Movilidad electroforética
     • Secuenciación de proteínas

6. Filogenia

   • Cronómetros moleculares
     • Las secuencias de ácidos nucleicos y proteínas cambian con el tiempo
   • Árboles filogenéticos
     • Representación en forma de árbol genealógico de la relación e historia evolutiva de diferentes organismos
       • Monofilético
         • Con antepasado común todos los descendientes
       • Parafilético
         • Faltan algunos descendientes
       • Polifilético
         • No tienen antepasado común cercano