Alinhamento Sequencial

Alinhamento Sequencial

1. Ferramenta essencial

   • Similaridade Genômica
     • Funcional
     • Infuncional
   • Identificação farmacologica
     • Relação DNA~Doença
     • Possiveis tratamentos

2. Conceitos

   • Identidade
     • Posição genômica idêntica
   • Similaridade
     • Identificação funcional
   • Homologia
     • Ancestral genômico comum
   • Genes Ortólogos
     • Origem distinta, porém funcionalmente similares
   • Genes Parálogos
     • Origem comum, porém funcionalmente diferentes
   • Gaps
     • Alteração genômica
   • Alinhamento
     • Sequencia de aminoácidos

3. Métodos

   • Simples
     • Local
     • Global
     • Relação entre duas sequencias
       • Algoritmos de identificação
         • Dinâmica
         • Matriz de pontos
         • Metodo de palavras
   • Multiplo
     • Local
       • Regioes
     • Global
       • Toda extensão genômica
     • Relação entre três ou mais sequencias
       • Algoritmos de identificação
         • Dinâmica
         • Progressivo
         • Pontuação
         • Interativo
         • Markov

4. Pratica

   • Selecionar uma proteína
     • UniProt
       • BlastP
         • Seeding
           • Começo do alinhamento
         • extension
           • Extensão do alinhamento
         • Evaluation
           • E-Value
             • Quanto menor, alta significância
             • Quanto maior, baixa significância