Bioinformática
27 recursos criados por 21 usuários
Esta página de Bioinformática no GoConqr reúne mapas mentais, anotações e flashcards sobre sequências biológicas, alinhamento, genômica e dados de microarray. Os materiais são voltados a universitários que querem revisar esses temas e a professores que procuram recursos para apoiar suas aulas. Há mais de 20 recursos de nível universitário, incluindo mais de 10 mapas mentais, criados com a contribuição de mais de 20 pessoas. Explore a seleção e escolha um material para começar.
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Notas
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Bionformática 1º teste - Resumo Prof Sequências Biológicas As sequências são representações incompletas do polímero biológico de tipo linear no qual se baseiam; Um polímero é constituído por uma sucessão de resíduos que resultam da incorporação dos monóm...
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ENCODE pesquisar: pub med genome browser, genome bioinformatics é bem mais eficiente salvar a informação dos cromossomos como RLE quando eles são ordenados por cromossomo porque se forem ordenados por cromossomo, as pr...
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reading microarray raw data vamos aprender como carregar o microarray data no r parsers: funções para ler arquivos de dados brutos como o .cell files file.path é uma função que junta o base directory e o actual file name para cri...
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getting the sequence of regions vamos aprender a usar eferencia completa da sequencia genomica do homo sapiens package em função olhar para o conteudo dos binding sites do receptor de estrogenio vamos entrar ERBS package e abrir o HepG2 data.&...
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Granges e biostrings o GRanges é uma extensão do IRanges para o meio genomico. as sequencias geralmente correspondem aos cromossomos. a funcão shift se relaciona com o final do cromossomo então vai para a direita e a função na...
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resumão modulo2 a função values extrai valores como: name, score, col, signalvalue, pvalue, qvalue, peak a função seqnames extrai os cromossomos de cada linha. se você usar a função as.character nele, então ele te...
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Sobre Bioinformática
GoConqr OriginalPor onde começar
A unidade Bioinformática faz parte da área de Aplicações de Dados em Domínios Específicos, na disciplina Bancos de dados e ciência de dados. A página reúne materiais criados por usuários do GoConqr, com formatos que permitem percorrer os temas de maneiras diferentes.
Para uma primeira visão, o mapa mental de apresentação da bioinformática aborda a organização e a interpretação de dados biológicos. Em seguida, as anotações sobre sequências biológicas ajudam a examinar como elas representam polímeros lineares e seus resíduos.
Comparar e alinhar sequências
Depois da introdução, os mapas de alinhamento de sequências oferecem caminhos para revisar a comparação entre sequências. O mapa Alinhamentos de Sequências apresenta temas como qualidade, sequenciamento e comparação de genomas. Já Alinhamento de sequências aborda identidade, análise evolutiva e alinhamentos simples e múltiplos.
Outros mapas da seleção tratam de similaridade, homologia e possíveis relações entre DNA e doença. Comparar os conceitos apresentados em cada material pode ajudar a organizar as anotações e identificar pontos a retomar.
Dados genômicos e ferramentas
Para avançar para exemplos de análise, há anotações sobre o acesso a regiões de uma sequência genômica e sobre a leitura de dados brutos de microarray no R. A seleção também inclui materiais sobre ENCODE, GRanges e Biostrings, além de flashcards sobre Bioconductor.
O mapa LEfSe e Biomarcadores Metagenômicos aborda o método LEfSe, a descoberta de biomarcadores, suas aplicações e desafios. Há ainda mapas sobre proteínas e sobre bioinformática aplicada à genômica, que podem complementar o percurso conforme o assunto de interesse.
Como revisar com os materiais
Os mapas mentais podem servir para visualizar relações entre conceitos; as anotações, para acompanhar descrições e exemplos. Ao terminar um mapa, vale formular perguntas sobre seus tópicos e procurar as respostas nas anotações relacionadas.
Não há quizzes nesta página para combinar diretamente com os mapas. Como alternativa, é possível usar as próprias perguntas para revisar o conteúdo e recorrer aos flashcards sobre Bioconductor quando esse for o tema de estudo. Escolha um dos materiais e monte seu percurso de revisão.
Perguntas frequentes
Qual material é uma boa opção para começar?
O mapa mental de apresentação da bioinformática é um ponto de partida para conhecer a organização e a interpretação de dados biológicos. Depois, as anotações sobre sequências biológicas e os mapas de alinhamento permitem acompanhar conceitos mais específicos. A ordem pode mudar conforme o tema que você deseja revisar.
O que os mapas mentais sobre alinhamento abordam?
Os mapas apresentam a comparação de sequências por perspectivas diferentes. Entre os tópicos estão identidade, similaridade, homologia, análise evolutiva e comparação de genomas. Um deles também distingue alinhamentos simples e múltiplos. Explorar mais de um mapa permite reunir esses conceitos em uma revisão.
Posso acessar os recursos gratuitamente?
Sim. Todos os recursos listados podem ser abertos e estudados gratuitamente, sem conta. Eles foram criados por usuários do GoConqr. Uma conta gratuita permite, além disso, criar quizzes, mapas mentais, flashcards e anotações próprios e salvar as pontuações dos quizzes.
A página tem quizzes de Bioinformática?
Não há quizzes nesta página. Para revisar, você pode usar os mapas mentais como roteiro e formular perguntas a partir dos conceitos apresentados. As anotações sobre sequências, dados genômicos e microarray oferecem outros materiais para consultar, e há flashcards sobre Bioconductor.
Para quem são os materiais desta unidade?
Os recursos são de nível universitário. Universitários podem usá-los para revisar sequências biológicas, alinhamento e análise de dados; professores podem consultar os materiais para apoiar suas aulas nesses temas. A seleção combina mapas mentais, anotações e flashcards, com diferentes recortes de bioinformática.