Diagrama de flujo
Diana
Contenido del diagrama
Interacciones fármaco-diana.
Bases para el diseño de nuevos fármacos
Dianas de fármacos
Fuentes de información
Bancos de datos de secuencias
Interacción ligando-diana
El agua y las proteínas
Diseño basado en la estructura
La elección de la diana
El sitio de unión
Métodos de obtención de información estructural
son
Macromoléculas que desempeñan funciones vitales en las células, cuya alteración está relacionada con ciertas enfermedades
La hipótesis de cómo modular su función relacionada con una enfermedad específica, da pie al desarrollo de un nuevo fármaco
Pueden estar presentes tanto en el hospedador como en el huésped, en enfermedades por patógenos
Incluyen proteínas, ácidos nucleicos, lípidos o carbohidratos
Formas de estudio
Cuando las dianas localizadas tanto en el hospedador como en el huésped, como sucede con los parásitos, se debe basar en las diferencias estructurales entre ambas dianas
Seleccionar como dianas enzimas o rutas biosintéticas presentes exlcusivamente en el huésped (parásitos)
Buscar dianas especifícas y exclusivas de un determinado patógeno; con ello, se limita la transferencia de factores de resistencia
Difracción de rayos-X
Espectometría de RMN
Difracción electrónica
Modelado de homología de proteínas
Información estática de la macromolécula empaquetada dentro de un cristal
Aplicado a proteínas incapaces de cristalizar, capaces de formar pseudocristales
No se dispone del modelo 3D de la proteína, pero se conoce su secuencia primaria. Se genera un modelo 3D a patir de la estructura 3D de otra proteína homóloga
Estdia a la diana en disolución e interpreta sus propiedades dinámicas
El banco de datos de proteínas de Brookhaven
(PDB)
Fuente de acceso libre en internet más importante
Es un archivo de estructuras cristalinas tridimensionales en forma de coordenadas cartesianas
También contiene datos sobre ADN,ARN, virus y carbohidratos
Esencial para el diseño de fármacos, la biotecnología, la bioquímica o la biología molecular
Si no se dispone de la estructura tridimensional de una macromolécula, pero se conoce su secuencia primaria; se puede acceder a:
NCBI, EBI O ExPASy: organizaciones de información masiva en el campo de genómica y proteómica
Su interpretación es fundamental para el desarrollo de nuevos fármacos
Las principales fuerzas implicadas en esta unión son las interacciones hidrofóbicas (afinidad) y electrostáticas (especificidad)
Los fármacos actúan uniéndose a determinadas macromoléculas diana (proteínas principalmente)en el sitio de acción
Agua determina las preferencias conformacionales de proteínas y ligandos; y modula las fuerzas de interacción
Las moléculas de agua, durante la formación del fármaco, tienen una contribución entrópica favorable
Su presencia resulta determinante para la unión o la función del fármaco al facilitar la acomodación de las partes hidrofílicas en interfases hidrofóbicas, las moléculas de agua incrementan la promiscuidad de los sitios de unión
El alto coste económico de los experimentos de unión diana-ligando y los chequeos farmacológicos conducen al uso de aproximaciones VIRTUALES
Los ensayos virtuales llamados "in silico" sustituyen los ensayos in vivo e in vitro
Es posible gracias a la disponibilidad de estructuras 3D de dianas y a las quimiotecas
en función de
Consideraciones biológicas
DIANA IDEL debe:
Estar involucrada en una enfermedad y unirse a pequeños liigandos, poseer un sitio de unión definido, ser esencial en algún punto del ciclo de vida del patógeno, ser única, y poder ser inhibida mediante la unión de pequeñas moléculas
Hueco profundo con una serie de grupos funcionales en las cadenas de los residuos capaces de establecer enlaces de hidrógeno, con propiedades hidrofóbicas y de volumen apropiado para acoger ligandos
Permite acceder a técnicas computacionales con el fin de optimizar candidatos a fármacos
Docking flexible, diseño de novo o el cribado virtual
Permiten evaluar cantidades inmensas de compuestos en 3D de forma ecnómica y proporciona líderes con propiedades fisico-químicas mejoradas
Información
- Descripción
- Diagrama sobre Diana , creado por Jaqueline Xicotencatl Melendez el 09/04/2021.
- Creado por
- Jaqueline Xicotencatl Melendez
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