Q.Orgánica capítulo 21

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Ácidos nucleicos
Andrés Aguilar Pérez
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Andrés Aguilar Pérez
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Question Answer
Ácidos nucleicos Forma parte de las 3 principales biomóleculas (carbohidratos, proteínas y ácidos nucleicos) Hay dos tipos de ácidos nucleoicos ADN y ARN
Síntesis de proteínas, ADN y ARN EL ADN codifica la totalidad de la información hereditaria de un organismo, controla el crecimiento y división de las células en todos lor organismos menos los virus(el ARN) La información se almacena en el ADN y es transcribida por el ARN y se traduce en la síntesis de proteínas requeridas para la estructura y función celular
21.1-Nucleósidos y nucleótidos Ver Pg.668 Los ácidos nucleicos son azúcares de 5 miembros unidos por grupos fosfatos Los enlaces son fosfodiésteres D-ribosa-azúcar del ARN 2-desoxi-D-ribosa-azúcar del ADN (no tiene un oxígeno en el carbono2') La base nitrogenadas(compuesto heterocíclico de aminas) se unen en el carbono anomérico del azúcar con un enlace Beta-glicósido
Las bases nitrogenadas del ADN y el ARN Ver Pg.669 Son únicamente 4 bases nitrógenadas En el ADN 2 Purinas sustituidas Adenina y Guanina 2 Pirimidinas sustituidas Citosina y Timina En el ARN son las mismas bases pero la Timina cambia por Uracilo Nota -> Las diferencias de herencia de las especies está determinada por la secuencia de las bases del ADN
Unión de las purinas y las pirimidinas con las bases nitrógenada El carbono anomérico del anillo de furanosa (D-Ribosa/2'-desoxi-D-Ribosa) se enlaza a las purinas en N-9 y a las pirimidinas en N-1 Nota -> Las posiciones del anillo de la base están indicadas con prima(') para distinguirlos de las posiciones del anillo de la base
Nucleósido Un compuesto que contiene una base unida a la D-Ribosa o la 2'-Desoxi-D-Ribosa se denomina un nucleósido Es decir: base+azúcar Ver Pg.670 al inicio
Nucleótido Un nucleótido es un nucleósido con un grupo OH en el Carbono 5' del azúcar unido a un ácido fosfórico mediante un enlace éster Es decir: base+azúcar+fosfato ADN-Desoxiribunocleótido ARN-Ribunocleótido Nota-> un nucleótido puede existir como monofosfato, difosfato o trifosfato Ejemplo 5-mono/di/tri fosfato de adenosina AMP/ADP/ATP
Nombres de nucleótidos Ver Pg.671-Tabla 21.1 Los nucleótidos se abrevian como: A,G,C,T seguido de MP,DP o TP si es un nucleótido de ADN se añade d antes del fosfato, ejemplo ATP/dATP
21.2-Ácidos nucleicos Los ácidos nucleicos están formados por largas hebras de subunidades de nucleótidos Dinucleótido-2 subunidades de nucleótidos Oligonucleótido-3 a 10 subunidades de nucleótidos Polinucleótido-Más de 10 subunidades de nucleótidos
Síntesis de ácidos nucleicos Los nucleósidos trifosfato son los materiales de partida para los ácidos nucleicos El ADN se sintetiza por enzimas de ADN polimerasas y el ARN por enzimas de ARN polimerasas Los nucleótidos se unen como resultado de la reacción SN2
Mecanismo de síntesis Ver Pg.672 SN2 Pasos 1-El grupo 3'-OH de un nucleósido trifosfato ataca al fósfoso alfa de otro nucleósido trifosfato, rompiendo un enlace fosfoanhídrido y eliminando el pirofosfato 2-El enlace fosfodiéster une el grupo 3'-OH de un nucleótido con el grupo 5'-OH del siguiente nucleótido y el polímero creciente se sintetiza en dirección 5'->3' Dicho de otra forma, los nuevos nucleótidos se agregan al extremo 3' Nota ->El pirofosfato es subsecuentemente hidrolizado, lo que hace la reacción irreversible Esto es importante para preservar la información génetica del ADN Las hebras de ARN se biosintetizan en la misma forma, utilizando ribonucleósidos trifosfato en lugar de 2'-desoxiribonucleósidos trifosfato
Estructura primaria de un ácido nucleico Es la secuencia de las bases en la hebra, esta por convenio se escribe de 5'->3' (el extremo 5' está a la izquierda) Ejemplo extremo 5'-ATGCTTAAGCGGGCT-extremo 3' Nota -> El nucleótido en el extremo 5' de la hebra tiene un grupo trifosfato en 5' sin enlazar El nucleótido en el extremo 3' tiene un grupo OH sin enlazar
21.3-Estructura secundaria del ADN El ADN consiste de 2 hebras de nucleótidos, con la cadena de azúcares-fosfato hacia el exterior y las bases hacia el interior Las 2 hebras son antiparalelas (corren en direcciones opuestas) Se unen entre sí por puentes de Hidrógeno entre las bases de una y otra hebra
Hebras complementarias La Adenina se asocia con la Timina por medio de dos enlaces de P.H La Citocina se asocia con la Guanina por medio de tres enlaces de P.H Nota -> Esto ocurre así (una Purina con una Pirimidina) para que el ancho de la molécula con dos hebras sea relativamente constante y para formar los puentes de hidrógeno respectivos
La doble hélice Ver Pg.674 Las dos hebras antiparalelas no son lineales sino que están retorcidas dentro de la hélice La doble hélice se asemeja a una escalera de caracol, los pares de base son los peldaños y la estructura principal de los azúcares y los fosfatos son los pasamanos Los fosfatos cargados negativamente repelen los nucleótidos, lo que evita la ruptura de los enlaces fosfodiéster También tenemos otras interacciones que contribuyen a la estabilidad de la molécula, como: La aromaticidad de las bases Fuerzas de Van Deer Waals/Interacciones de apilamiento Los surcos mayor y menor se alternan en la hélice y son sitios de unión para proteínas y otras moléculas
21.8-Estructura del ARN Son moléculas mucho más cortas que el ADN(máximo de 10 000 nucleótidos) y tienen una sola hebra
Tipos de ARN ARNm Su secuencia determina la secuencia de aminoácidos de la proteína ARNr Es un componente estructural de los ribosomas, las cuales son las particulas donde tiene lugar la biosíntesis de las proteínas ARNt Es el portador de los aminoácidos utilizados para la síntesis de proteínas
Estructura de la cadena monocatenaria de ARNt Ver Pg.679 Se pliega como hoja de trebol, con tres bucles y una pequeña protuberancia próxima al bucle derecho Hay al menos cuatro regiones con apareamiento de bases complementarias Las tres bases en el fondo del bucle opuestas directamente de los extremos 5' y 3' se llama anticodón Todos los ARNt tienen una secuencia de bases CAA en el extremo 3' Cada ARNt puede llevar un aminoácido enlazado con un éster en su grupo 3'-OH terminal El aminoácido se insertará en una proteína durante la biosíntesis de proteínas Cada ARNt puede portar solo un determinado aminoácido, por ejemplo un ARNt que porta alanina se denomina como ARNt Ala La unión de un aminoácido a un ARNt es catalizada por una enzima llamada aminoácil-ARNt sintetasa
Mecanimos de la unión de un aminoácido a un ARNt Ver Pg.679 Pasos 1-El grupo carboxilato del aminoácido se activa formando un adenilato de acilo; ahora el aminoácido tiene un buen grupo saliente 2-El pirofosfato es eliminado y subsecuentemente hidrolizado, asegurando la irreversibilidad de la reacciónd de fosforilación 3-El segundo y tercer paso son los pasos de una sustitución nulceófila de acilo. El grupo 3'-OH de un ARNt ataca al carbono carbonilo de un adenilato de acilo, formando un intermediario tetrahédrico 4-El aminoacil ARNt se forma cuando el AMP se elimina del intermedio tetrahédrico Nota-> Todas las reacciones tienen lugar en el sitio activo de la enzima Cada aminoácido tiene una aminoacil-ARNt sintetasa Cada sintetasa tiene dos sitios específicos de unión, uno para el aminoácido y el otro para el ARNt que portará el aminoácido
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