Citogenética del cáncer

Citogenética del cáncer

1. Citogenética Molecular

   • FISH:
     • Las sondas de ADN se marcan con diferentes marcadores fluorescentes de colores para visualizar una o más regiones específicas del genoma
       • Características:
         • Prueba rápida y sensible para la detección de cambios cromosómicos crípticos o sutiles
           • Detecta alteraciones genéticas en poblaciones de células que no se dividen
             • Selección de sondas FISH para uso en oncología
               • 1) sondas de pintura de cromosomas completos (WCP) para descifrar las aberraciones citogenéticas
                 • 2) sondas de secuencia repetitivas para la enumeración de cromosomas.
                   • 3) sondas de identificador específico de locus (LSI) para fusiones de genes, deleciones de genes o duplicaciones .
                     • Avances tecnológicos:
                       • CGH, SKY, M-FISH, mBAND y aCGH. Agregan colores a las bandas convencionales
   • 5 pasos:
     • 1) pretratamiento de la muestra
       • 2) desnaturalización de la sonda y muestra
         • 3) hibridación de la sonda con las células diana o metaphase spreads
           • 4) lavado posterior a la hibridación
             • 5) detección usando un microscopio de epifluorescencia simple

2. Recursos Citogenéticos del Cáncer

   • Base de datos Mitelman de aberraciones cromosómicas y fusiones génicas en el cáncer
     • Casos de tumores, en los que se han notificado aberraciones citogenéticas, es de 64.319
   • El Atlas de Genética y Citogenética en Oncología y Hematología
     • Base de datos dedicada a genes, citogenéticas y entidades clínicas en cáncer y enfermedades propensas al cáncer.
   • Nomenclatura citogenética
     • Términos definidos y convenciones de sintaxis que minimizan la complejidad y añaden precisión al proceso. Se basa en los informes del Sistema Internacional de Nomenclatura Citogenética Humana (ISCN)

3. Citogenética convencional

   • Análisis cromosómico
     • Detecta: anormalidades citogeneticas clonales, en casos como leucemia.
       • Adquirida
         • *AML, MDS y trisomía 8
       • Heredada
         • Trisomía 21
     • 5 pasos :
       • 1) Cultivo celular
         • 2) Cultivo de cromosomas en metafase
           • 3) Preparación de cromosomas
             • 4) Bandas y tinción, usando un protocolo especial
               • 5) Análisis por microscopía óptica
                 • Proporciona: visión general de todas las aberraciones cromosómicas en una sola célula tumoral.
                   • Resultados impredecibles = no existe una técnica garantizable
                     • Resultado exitoso = establecer cultivos múltiples para maximizar las posibilidades de obtener divisiones óptimas de células malignas:
                       • 1) cosecha directa de células de médula ósea
                       • 3) cultivo nocturno con sincronización (bloqueando en la fase S del ciclo celular)
                         • Diagnóstico:
                           • FISH, RT-PCR y Southern Blot.
                       • 2) cultivo durante la noche
                 • Características:
     • Mecanismos que generan anormalidades cromosómicas
       • 1) Ganancia neta y pérdida de material cromosómico
         • Genes relevantes para el cáncer:
           • Oncogenes
           • Genes supresores de tumores
       • Reordenamientos cromosómicos
         • Una parte de un cromosoma se separa y se une a otro cromosoma.
         • Translocación equilibrada
           • Los trozos de cromosomas se encuentran a distancia, pero no se gana ni pierde material genético en la célula

4. Cromosoma Filadelfia (distintivo de CML)