R e Bioconductor
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Notas
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ENCODE pesquisar: pub med genome browser, genome bioinformatics é bem mais eficiente salvar a informação dos cromossomos como RLE quando eles são ordenados por cromossomo porque se forem ordenados por cromossomo, as pr...
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reading microarray raw data vamos aprender como carregar o microarray data no r parsers: funções para ler arquivos de dados brutos como o .cell files file.path é uma função que junta o base directory e o actual file name para cri...
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getting the sequence of regions vamos aprender a usar eferencia completa da sequencia genomica do homo sapiens package em função olhar para o conteudo dos binding sites do receptor de estrogenio vamos entrar ERBS package e abrir o HepG2 data.&...
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Granges e biostrings o GRanges é uma extensão do IRanges para o meio genomico. as sequencias geralmente correspondem aos cromossomos. a funcão shift se relaciona com o final do cromossomo então vai para a direita e a função na...
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resumão modulo2 a função values extrai valores como: name, score, col, signalvalue, pvalue, qvalue, peak a função seqnames extrai os cromossomos de cada linha. se você usar a função as.character nele, então ele te...