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Flowchart

Diana

Jaqueline Xicotencatl Melendez Spanish

Flowchart content

  1. Interacciones fármaco-diana.

    Bases para el diseño de nuevos fármacos

  2. Dianas de fármacos

  3. Fuentes de información

  4. Bancos de datos de secuencias

  5. Interacción ligando-diana

  6. El agua y las proteínas

  7. Diseño basado en la estructura

  8. La elección de la diana

  9. El sitio de unión

  10. Métodos de obtención de información estructural

  11. son

  12. Macromoléculas que desempeñan funciones vitales en las células, cuya alteración está relacionada con ciertas enfermedades

  13. La hipótesis de cómo modular su función relacionada con una enfermedad específica, da pie al desarrollo de un nuevo fármaco

  14. Pueden estar presentes tanto en el hospedador como en el huésped, en enfermedades por patógenos

  15. Incluyen proteínas, ácidos nucleicos, lípidos o carbohidratos

  16. Formas de estudio

  17. Cuando las dianas localizadas tanto en el hospedador como en el huésped, como sucede con los parásitos, se debe basar en las diferencias estructurales entre ambas dianas

  18. Seleccionar como dianas enzimas o rutas biosintéticas presentes exlcusivamente en el huésped (parásitos)

  19. Buscar dianas especifícas y exclusivas de un determinado patógeno; con ello, se limita la transferencia de factores de resistencia

  20. Difracción de rayos-X

  21. Espectometría de RMN

  22. Difracción electrónica

  23. Modelado de homología de proteínas

  24. Información estática de la macromolécula empaquetada dentro de un cristal

  25. Aplicado a proteínas incapaces de cristalizar, capaces de formar pseudocristales

  26. No se dispone del modelo 3D de la proteína, pero se conoce su secuencia primaria. Se genera un modelo 3D a patir de la estructura 3D de otra proteína homóloga

  27. Estdia a la diana en disolución e interpreta sus propiedades dinámicas

  28. El banco de datos de proteínas de Brookhaven

    ​​​​​​(PDB)

  29. Fuente de acceso libre en internet más importante

  30. Es un archivo de estructuras cristalinas tridimensionales en forma de coordenadas cartesianas

  31. También contiene datos sobre ADN,ARN, virus y carbohidratos

  32. Esencial para el diseño de fármacos, la biotecnología, la bioquímica o la biología molecular

  33. Si no se dispone de la estructura tridimensional de una macromolécula, pero se conoce su secuencia primaria; se puede acceder a:

  34. NCBI, EBI O ExPASy: organizaciones de información masiva en el campo de genómica y proteómica

  35. Su interpretación es fundamental para el desarrollo de nuevos fármacos

  36. Las principales fuerzas implicadas en esta unión son las interacciones hidrofóbicas (afinidad) y electrostáticas (especificidad)

  37. Los fármacos actúan uniéndose a determinadas macromoléculas diana (proteínas principalmente)en el sitio de acción

  38. Agua determina las preferencias conformacionales de proteínas y ligandos; y modula las fuerzas de interacción

  39. Las moléculas de agua, durante la formación del fármaco, tienen una contribución entrópica favorable

  40. Su presencia resulta determinante para la unión o la función del fármaco al facilitar la acomodación de las partes hidrofílicas en interfases hidrofóbicas, las moléculas de agua incrementan la promiscuidad de los sitios de unión

  41. El alto coste económico de los experimentos de unión diana-ligando y los chequeos farmacológicos conducen al uso de aproximaciones VIRTUALES

  42. Los ensayos virtuales llamados "in silico" sustituyen los ensayos in vivo e in vitro

  43. Es posible gracias a la disponibilidad de estructuras 3D de dianas y a las quimiotecas

  44. en función de

  45. Consideraciones biológicas

  46. DIANA IDEL debe:

  47. Estar involucrada en una enfermedad y unirse a pequeños liigandos, poseer un sitio de unión definido, ser esencial en algún punto del ciclo de vida del patógeno, ser única, y poder ser inhibida mediante la unión de pequeñas moléculas

  48. Hueco profundo con una serie de grupos funcionales en las cadenas de los residuos capaces de establecer enlaces de hidrógeno, con propiedades hidrofóbicas y de volumen apropiado para acoger ligandos

  49. Permite acceder a técnicas computacionales con el fin de optimizar candidatos a fármacos

  50. Docking flexible, diseño de novo o el cribado virtual

  51. Permiten evaluar cantidades inmensas de compuestos en 3D de forma ecnómica y proporciona líderes con propiedades fisico-químicas mejoradas

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Flowchart on Diana , created by Jaqueline Xicotencatl Melendez on 09/04/2021.
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