secuenciacion de acidos nucleicos

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Yurany  Carreño
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Yurany  Carreño
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secuenciacion de acidos nucleicos
  1. Básicamente Involucra
    1. 1. La degradación específica y el fraccionamiento de los polinucleótidos a fragmentos pequeños
      1. 2. La secuenciación de los fragmentos pequeños
        1. 3. El uso de un procedimiento de degradación que produce una serie de fragmentos de polinucleótidos que traslapan el punto de corte en la serie
        2. Historia
          1. Inicialmente se secuenció usando método similares a los usados para secuenciar proteínas
            1. F. Sanger et al. desarrollaron técnicas de fraccionamiento más rápidas y simples para secuenciación de ARN y ADN.
              1. Más adelante desarrollaron un método más eficiente: el enzimático
              2. Luego de 1975 hubo avances significativos
                1. -Descubrimiento de enzimas que cortan el ADN en secuencias específicas. -Técnicas de clonación para secuenciar segmentos de ADN
              3. Métodos
                1. Degradación química (Maxam & Gilbert, 1977). Puede determinar la secuencia desde la primera base. Es el más adecuado para determinar la secuencia de fragmentos cortos.
                  1. Los fragmento de ADN separados se unen por electroforesis. Las reacciones químicas en este proceso son las siguientes: 1) Corte de purinas. 2) Corte de adeninas. 3) Corte de pirimidinas. 4) Corte de citosina.
                  2. Método enzimático (Sanger et al., 1977). Consiste en la utilización de la molécula ADN polimerasa para sintetizar cadenas de ADN con terminación específica.
                    1. Se llevan a cabo cuatro reacciones con ddNTPs diferentes para que se sinteticen distintos fragmentos que puedan ser separados con electroforesis y poder determinar la secuencia del tempaldo.
                  3. Secuenciación contemporánea
                    1. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR):
                      1. Permite la amplificación exponencial del ADN, produciendo millones de copias de un fragmento. Se genera gracias a la acción de los oligonucleótidos ya que contienen un extremo 3`libre que es complementario con la cadena molde del ADN.
                        1. Este proceso consta de tres pasos: 1) Desnaturalización de las hebras de ADN. 2) Temperatura de alineamiento. 3) Extensión de la cadena de ADN.
                        2. Polimerasa Taq:
                          1. Permitió automatizar la reacción de PCR, sin tener que adicionar enzimas nuevas en cada reacción, debido a que resiste altas temperaturas
                            1. Fue aislada de la bacteria Thermus aquaticus
                            2. Marcaje del ADN:
                              1. Se realiza mediante la utilización de fluoróforos, debido a que el trabajo con isótopos radioactivos utilizados anteriormente, es demorado, costoso y peligroso
                                1. Adicionalmente las moléculas fluorescentes contribuyen a la automatización de la secuenciación de los ácidos nucleicos.
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