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SISTEMA RLS

Dalia Ramirez Spanish

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SISTEMA RLS

componentes
- bases nitrogenadas
  - purinas
    - DNA
      - adenina
        equilibrio amino-imino
      - guanina
        equilibrio de 1 grupo ceto>enol
        equilibrio amino>imino
    - dos anillos heterocíclicos
  - pirimidinas
    - RNA
      - uracilo
    - DNA
      - timina
        equilibrio ceto-enol
      - citosina
        equilibrio de 1 grupo ceto>enol
        equilibrio 1 grupo amino>imino
    - un anillo heterociclico
  - unión por puentes de hidrógeno
    - unión a la misma distancia
      - ambos anillos planos
        A=T
        G=C
        mayor estabilidad y fuerza
        uniones Watson-Crick
- azucar
  - RNA
    - ribosa
      - conformación de sobre
  - DNA
    - Desoxiribosa
      - conformación de sobre
  - proveniente de la via de las penosas
  - pentosa
    - endo
      - carbono 2
        más estable
        grupos fosfatos más separados
        7.0 A de distancia
      - carbono 3
        no estable
        mayor repulsión e impedimento esterico
        grupos fosfatos más cercanos
        5.9 A de distancia
    - exo
      - carbono 1
- grupo fosfato
  - Forma un puente entre grupos OH de dos azúcares sucesivos (posiciones 3’ de un azúcar y 5’ del siguiente
    - proporciona la forma de espiral
  - carga negativa
    - impide que el DNA se doble
- formación de:
  - nucleósidos
    - base nitrogenada + azucar
      - unión por enlace N-glicosídico
        pirimidinas
        enlace N1-glicosídico
        purinas
        enlace N9-glicosídico
      - posición de la base con respecto al azúcar
        anti
  - nucleótidos
    - base nitrogenada + azucar+ fosfato
      - ácido adenílico
      - ácido guanílico
      - ácido citidílico
      - ácido timidílico
      - ácido uridílico
DNA
- polímero de nucleótidos
  - derivados de aminoácidos
    - aspártico, glutamina y glicina
      - Purinas
    - aspártico y glutamina
      - Pirimidinas
- características
  - doble hélice
  - 22-26 A de diametro
  - 10 pares de bases = 1 vuelta
    - 34 A
      - dextrógiro
        DNA B
  - surco mayor = 22 A, surco menor = 12 A
    - surco mayor interactúa con más moléculas
tipos de DNA
- DNA A
  - caractrísticas
    - orificio central más grande
    - surco mayor más extendido, surco menor menos extendido
      - menos profundidad
    - formación espontánea al disminuir humedad
    - más compacto
      - conformación ribosa C3- endo
    - dextrógiro
    - diámetro hélice
      - 2.55 nm
    - 11 pares de bases por vuelta
- DNA B
  - características
    - dextrógiro
    - diámetro hélice
      - 2.37 nm
    - surco mayor y menor con profundidad media
    - 10 pares de bases por vuelta
    - conformación ribosa C2-endo
- DNA Z
  - características
    - levógiro
    - surco mayor sin profundidad
    - diámetro de hélice
      - 1.84 nm
    - 12 pares de bases por vuelta
    - conformación ribosa
      - purinas
        C3-endo
      - pirimidinas
        C2-endo
    - orificio más pequeño
    - grupos fosfatos en zig-zag
    - conformación enlace N glicosídico
      - anti en pirimidinas
      - syn en purinas
estructuras
- primaria
  - secuencia de nucleótidos
- secundaria
  - doble hélice
    - dextrógira o levógira
    - cadenas antiparalelas
  - triplex
    - sitios de regulación para transcripción de genes
  - cruciforme
  - cuadruplex
    - regiones ricas en guaninas
      - en telomeros
    - DNA i
- terciaria
  - procariontes
    - DNA superhélice en forma circular
  - eucariontes
    - empaquetamiento en histonas
- cuaternaria
  - nucleosomas. DNA en histonas y espaciador
    - fibra de DNA asociada a histonas. Cuentas de rosario
      - solenoide
        asas
        cromosomas