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desviacion MT

Dalia Ramirez Spanish

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desviacion MT

enfecto en
- Promotor
  - aumentar o disminuir la tasa de transcripción
- Elemento de respuesta
  - eliminar la habilidad del gen de ser regulado
- 5' UTR/ 3' UTR
  - alterar la habilidad del RNA de ser traducido
- Secuencia de reconocimiento de intrones
  - alterar la habilidad de eliminar intrones
- genes reguladores
  - afectan la expresión correcta de la proteína
tipos
- mutacion germinal
  - afecta a todas las células del embrión. Heredable
- mutación somática
  - afecta sólo la estirpe celular donde ocurrió la mutación. No heredable
clasificación
- espontánea
  - bajo condiciones controladas suceden de manera normal en el organismo
    - ejemplos
      - recombinación aberrante
        entrecruzamiento anormal
        eliminaciones, duplicaciones, traslaciones e inversiones de segmentos génicos
      - segregación aberrante
        aneuploidía o poliploidía
      - error en replicación del DNA
        mutaciones puntuales
        a causa de:
        cambio de forma tautomérica
        mismatch= par de bases erróneo
        debido a:
        1) No hay reparación eficiente
        2) Ocurren dos rondas de replicación
        apareamiento de las formas cetónicas: A*-C, T*-G, G*-T y C*-A
        Deslizamiento de cadenas
        ocurre por secuencias repetidas
        La DNA polimerasa al regresar para editar, puede deslizar la cadena
        efecto
        deslizamiento de cadena nueva
        adición de nucleótido
        deslizamiento de cadena molde
        deleción de nucleótido
      - productos metabólicos tóxicos
        ROS y NOS alteran estructura del DNA
        promueven que el tautómero raro (enol o imino) establezca eficientemente puentes de hidrógeno
        ejemplos
        a) glicol de timina
        b) 8-oxo-guanina
      - elementos transponibles
        insertarse dentro de un gen
        promotor inactivado o cambio del marco de lectura
      - daño en DNA
        ejemplos
        pérdida espontánea de bases
        purinas
        pirimidinas
        generación de sitios abásicos
        adición posterior de bases incorrectas
        desaminación
        predominante en purinas que pirimidinas
        ejemplos
        adenina a xantina
        citosina a uracilo
        guanina a xantina
        metilación espontánea de bases
        ejemplos
        7-metil-guanina
        3-metil-adenina
        apareamiento incorrecto de bases
- inducida
  - consecuencia de la exposición a mutágenos químicos o biológicos o a radiaciones
    - químicos
      - ejemplos
        análogos de bases
        5-bromouracilo
        análogo de la timina
        inserción de guaninas
        preferentemente forma enólica
        agentes alquilantes
        etilmetanosulfonato (EMS)
        guanina + EMS
        etilguanina
        aparea con timina
        transición G-C a A-T
        agentes intercalantes
        bromuro de etidio
        generación de sitios abásicos
        adición posterior de bases incorrectas
    - biológicos
      - virus y bacterias
        ejemplo
        aflatoxina
        generación de sitios abásicos
        desplaza el equilibrio ceto-enólico
        apareamiento incorrecto de bases
    - fisicos
      - luz UV
        provoca dímeros de pirimidinas
        T-T>T-C=C-T>C-C
Estrategias de reparación
- reversión de daño
  - sistema de fotorreactivación
    - eliminación de dímeros de timina por la DNA fotoliasa
  - sistema de alquil-transferasa
    - reversión de la metilación por alquil-transferasas
- corrección del DNA dañado
  - Mismatch repair (MMR)
    - bases no complementarias
    - inserciones
    - actua después de la replicación
    - procedimiento
      - corta enlace fosfodiester (muesca)
        corta cadena donde está la muesca
        corta hasta el mismatch
        DNA polimerasa replica
        ligasa sella
  - Reparación por escisión de bases (BER)
    - exclusivo para nucleótidos no convencionales
    - DNA glicosidasa rompe enlace glicosídico
      - generación de sitio abásico
        endonucleasa hace una muesca
        DNA polimerasa elimina azucar y fosfato
        DNA polimerasa replica
        ligasa sella
  - Reparación por escisión de nucleótidos (NER)
    - exonucleasa elimina fragmento de DNA
      - DNA polimerasa replica
        ligasa sella
  - Reparación postreplicativa
    - por recombinación se rellena el hueco proveniente de un molde dañado
      - replicación del DNA
        reparación por escisión de nucleótido
  - Síntesis traslesión
    - recombinación para replicar la cadena con daño
      - polimerasas de baja especificidad para rellenar el hueco de la cadena sin lesión
cambio en la secuencia del DNA
- puntual
  - afecta una base o un gen
- megamutación
  - afecta kilobases o una sección cromosómica
según mecanismo
- genética
  - afecta genes individuales
  - por sustitución, delación o inserción de bases
- cromosómica
  - inversiones, delaciones o duplicaciones, traslaciones
  - altera cromosoma
- genómica
  - poliploidía o aneuploidía
  - afecta genoma
silenciosa (silent)
- no hay cambio en el aminoácido
conservativa
- aminoácidos equivalentes
frameshift
- corrimiento del marco de lectura
sin sentido
- codon de paro
cambio de sentido
- cambio de aminoácido
reversas
- reversión fenotipo original
- revertantes
  - mismo fenotipo, diferente genotipo
    - equivalentes
- supresora
  - intragénica
  - extragénica