Digital PCR as a tool to measure HIV persistence

Digital PCR as a tool to measure HIV persistence

1. ¿QUE ES?

   • La PCR digital (dPCR) se ha convertido en una poderosa herramienta para cuantificar y vigilar con precisión la persistencia del VIH en las personas que viven con el VIH/SIDA.
     • Esta técnica permite una medición sensible y precisa del reservorio viral,
       • que se refiere al grupo de células infectadas por el VIH
         • no producen activamente el virus pero que pueden conducir a la replicación del virus cuando se detiene la terapia antirretroviral (TRA).

2. Ventajas

   • La eficiencia de amplificación puede verse afectada por los inhibidores
   • La tolerancia a la variación de la secuencia objetivo es especialmente crucial para la cuantificación del VIH
     • se espera una mayor probabilidad de desajustes con el conjunto de la sonda de cebado debido a la alta heterogeneidad del virus

3. Aplicabilidad y perspectivas futuras

   • Donde algunas plataformas limitan el número de dispositivos especializados necesarios (microplaca del sistema de PCR digital CONSTELLATION de Formulatrix)
     • otras compañías están trabajando en un sistema multiplex de hasta 6 colores (sistema Naica de Stilla)
     • La plataforma de PCR digital QX200 puede beneficiarse de un clasificador de fluorescencia integrado para el análisis post-PCR de gotas.
     • permiten el análisis de muestras múltiples en una sola pasada (QX200 de Bio- Rad)

4. Digital PCR as a Tool for Monitoring HIV Reservoirs" por Kiselinova et al. (2019)

   • Falsos positivos
   • ¿Que destaca?
     • sensibilidad, precisión y capacidad para detectar células raras infectadas por el VIH.
   • ¿Qué estudia?
     • visión general de la tecnología dPCR y sus aplicaciones en la medición de reservorios de VIH.
       • analizan las ventajas del dPCR sobre la PCR tradicional y otros métodos de cuantificación

5. Antecedentes

   • La herramienta estándar para cuantificar el ADN del VIH y el ARN viral asociado a las células ha sido la PCR en tiempo real (qPCR
     • Digital PCR se basa en el concepto de limitar la dilución donde las moléculas objetivo son dividido al azar entre una multitud de particiones

6. Retrovirology [Retrovirology] 2018 Jan 30; Vol. 15 (1), pp. 16. Date of Electronic Publication: 2018 Jan 30.