Microarrays - created from Mind Map

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Printed Microarrays

In-Situ-Synthesized oligonucleotide microarray

Aplicaciones potenciales

Determinación de resistencia a fármacos

Conclusiones

High Density Bead Arrays

Electronic Microarray

Suspension bead Arrays

superficie cristal microscopica

Impresion sin- contacto o por-contacto

DNA doble cadena

Oligonucleotido

Ampliaciones por PCR

Secuencias Quimicas cortas sintetizadas (25-80pb)

1.- Optima extensión de prueba

2.- Pruebas con temp. de fusión (5c)

3.- Union covalente de oligonucleotido a cristal.

Síntesis de oligonucleotidos directo en Microrray (20-25pb)

Múltiples pruebas por objetivo

Síntesis Fetoquimicas basada en semiconductores

Nimble gen

Plataforma Ahgant

Chip Gen

Patógenos

Resistencia Microbiana

Detección e Identificación de patógenos

Microrray based Multiplex

Amplificación especifica de genes microbianos

Responden a estímulos y a interacciones con el inaspedador

Detección de patógenos vias aéreas

Array tube platform

Staphplex

Affimetrix Gene Chip

Greene Chip Resp.

Viro-Chip

Nivel de especie y nivel de cepa

Influenza A

Identificación precisa

Identificar y caracterizar Sthaphyloccocus

Resistencia antibiótica, Identificación,detección de penton-valentine.

Funciones de microrrays

En comparación con PCR tiempo real.

Revolucionara el Dx. de enfermedades infecciosas identificando patógenos desconocidos.

Desventajas.

Detección, Identificación,tipicacion de: patógenos microbios

Determinación de resistencia de patógenos microbianos.

Seguimiento de infecciones microbianas.

Microrrays requiere

Hibridación y lavado

Aumenta riesgo de contaminación y aumento de tiempo.

Mayor costo

Caudal limitado.

No tienen mucha flexibilidad.

Detección de alta densidad Ac. nucleicos marcados

Universal Grays

no usa: Glass slides and Silicon wafers

usa: 3mm de silica.

Universal bead array

The secitrix Array Matrix (SAM)

Contiene 96, cada uno contiene 50,000, 5mm light conectan fiber

La distancia entre array individual en 16 muestras es ideal.

1536 tipos, cada uno con secuencia única

Bead chip

puede ensayar 1-16muestras al mismo tiempo en slide silicon

Decoding.- to use internal dyes

10 para determinar SNP

Encoding

Cada bead tiene 700,000 copias.

Secuencias especificas y homologas entre humano y ratón

Illumincodes

Mapeo

Hibridación

Paso de enjuague

Controla el transporte de Ac. nucleicos por medio de campos eléctricos.

Microelectric Cartridges usa un metal oxido conductor para Ac. nucleicos

Tiene 12 conectores para 400 pruebas individuales.

La superficie del microarray contiene 2 treptavia que sirve de marcaje.

3era division-- usa microesferas y citometria.

Detección de Ag.-Ae.

1.- Se les pasan dos laser

Cuando el DNAm se une al molde

a) 635nm para excitar la parte roja e infrared therochromes

b) 532 m laser excita reportero flurochroomas R-phycoerytin

Allele- specific primer extent (ASPE)

Oligonucleotid Ligation (OLA)

Single Base - chain (SBE)