Flashcards
Hankeln 2
Cards in this deck (15)
- 1Was ist Genomannotation?Genorte finden und alle kodierenden Regionen (locate)
Herausfinden was dieses Gen macht - 2Werden alle Gene in Proteine übersetzt?Nein, das Humangenom hat > 20 000 RNA Gene
- 3Werden alle Genregionen proteinkodierender Gene in Proteine übersetzt?Nein es gibt auch untranslatierte Exons
- 4Was ist alternatives Spleißen?Eukaryotische Gene werden nach Transkription
alternativ gespleißt. Die mRNA-Spleißvarianten können
unterschiedliche Proteine kodieren.
(Eine mRNA, mehrere Proteine) - 5Wie sind unsere Gene struckturiert, warum wird dadurch die Gen Identifizierung bei EK erschwert?Mosaikgene aus vielen Introns und Exons
Funktionelle Teile eines Gens sind als Schnipsel (Exons)
verteilt (durchschnittliche Länge: nur 145 Basenpaare)
=> Nadeln im Heuhaufen - 6Was kann auf ein Gen hindeuten?Startkodons, Stopkodons > ORFS („open reading frames“)
• Spleiß-Donor/Akzeptor-Stellen (“GT-intron-AG“)
• Promoter: Bindemotive für Transkriptionsfaktoren („Boxen“)
Startpunkt der Transkription (+1, cap site)
CpG-Inseln
• Polyadenylierungssignal (AATAAA) am Ende des Transkripts - 7Welcher Strang kodiert für ein GEn?Beide Stränge!
manche Gene überlappen, dh.: beide Stränge der DNA kodieren dort - 8Wie sind Bakteriengene aufgebaut?in Operons
Reihe von 2 oder mehr Genen und regulatorischen Sequenzen
Proteine werden so koordiniert exprimiert und besitzen eng verwandte Funktionen - 9Wie liegen die Gene bei Viren vor?• Gene liegen sehr dicht gepackt
• Gene können partiell überlappen
• beide Stränge der DNA kodieren - 10Was sind die zwei Strategien der gensuche?DE NOVO Genvorhersage
-> ich wende Allgemeinwissen an, wie Gene „gebaut“ sind
DATENBANKSUCHE
-> ich suche: gibt es woanders schon ähnliche Gene? - 11Was sind ORFs?Hypothese auf eine Potentielle Proteinkodierende Region
Teil einer DNA Sequenz ohne Stop Codons, wobei Start Codons durchaus enthalten sein können
Mit insgesammt 6 möglichen Frames
(Sequenz aufgeteilt in dreier sets, nicht überlappender Triplets) - 12Welches Modell/Programm kann zur Genvorhersage benutzt werden?z.B.: Das Hidden Markov Model (HMM)
hier werden tatistische Kenntnisse zur Architektur
von Genen benutzt - 13Was ist das HMMverwende statistische Informationen, um Abfolgen (Reihe von ZUständen mit einer gewissen W'keit) (z. B.
Sequenzen) zu klassifizieren
- 14Was ist die Emissions, und was ist die Übergangswahrscheinlichkeit?Emission?
-> W'keit für Base ACGT
Übergangsw'keit?
-> Übergang zu Base ACGT - 15Wozu dient das HMM?> Vorhersage der Genstruktur (Exons/Introns)
> Vorhersage von Promoterbereichen
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- User has deleted their subject information Flashcards on Hankeln 2, created by Deleted user on 17/09/2024.
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- Deleted user · Sep 2024
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- Sep 17, 2024
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- Created by Alicia L · Sep 17, 2024
- Copied by Alicia L · Sep 17, 2024
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