Aplicación de tecnologías de secuenciación de vanguardia a fermentaciones de alimentos indígenas

Aplicación de tecnologías de secuenciación de vanguardia a fermentaciones de alimentos indígenas

1. Comidas y bebidas fermentadas

   • Procesos de fermentación
     • Rebobinado
   • Nuevas tecnologías de secuenciación
     • Filobiomas,
     • Metagenomas
     • Metatranscriptomes
   • Materias primas disponibles

2. Técnicas moleculares

   • Illumina
     • Técnica de secuenciación
     • Millones de lecturas cortas
   • DGGE de 16S rRNA
     • "Huella dactilar de la comunidad"
     • ADN amplificado por PCR de rRNA 16S o 18S
     • microbianas mixtas
   • ARDRA
     • Análisis de restricción
     • ADN ribosomal amplificado.
   • Secuenciación 16S rDNA
     • Secuenciación de amplicones de PCR
     • Múltiples regiones variables (V)
     • Gen bacteriano 16S.
   • RNA-seq
     • ARN de transcripción inversa de ADNc.
     • Próxima generación
   • Metagenómica
     • Muestra ambiental
     • Método (s) de secuenciación al ADN
   • Montaje
     • Secuencias contiguas
     • Alineación de lecturas

3. Perfiles microbianos de la comunidad

   • DGGE de 16S rRNA
     • visualizar perfiles de la masa de maíz y quesos artesanales
       • Aislamiento de bandas de geles
       • Bibliotecas de clones
   • ADNr amplificado por PCR
     • Caracterizar y perfilar
     • Ecosistemas de fermentación microbiana
   • Alimentos fermentados
     • Pulque: bebida alcohólica
     • kimchi: repollo y rábano
     • narezushi: pescado
     • doenjang: soja pasta
     • kochujang
     • mariscos y salvado de arroz

4. Genómica de microbios de fermentaciones tradicionales

   • Potencial metabólico codificado por genomas individuales afecta la fermentación
     • Análisis genómico comparativo
       • Lactobacillus sakei
         • fermentación de la carne
       • L. sanfranciscensis
         • Masas crudas tradicionales de trigo y centeno

5. Metagenómica y metatranscriptómica

   • Interactúan las bacterias
     • Estudio de metagenómica
       • kimchi
         • Poblaciones microbianas
         • Leuconostoc mesenteriodes
         • Lactobacillus sakei en kimchi
     • Metatranscriptómico
       • Microarrays
         • Masa fermentada
         • Transcriptoma de L. plantarum y L. fermentum
         • Ecosistema estabilizado
   • Presencia de cadenas tróficas

6. Realizado por: Myriam Córdoba