Alinhamento de Sequência

Alinhamento de Sequência

1. Os conceitos

   • Identidade
   • Similaridade
     • Genes parálogos vs Genes ortólogos
   • Homogenia

2. Pra que serve

   • Análise de sequências biológicas
     • Relação evolutiva

3. Métodos de alinhamento

   • Simples
   • Múltiplo
   • Local
     • Programação Dinâmica
       • Útil para comparar sequências de proteínas que têm um motivo ou domínio em comum, mas que diferem no restante da sequência
     • Método de Palavras
       • Útil quando se busca similaridade de uma única sequência contra um grande conjunto de dados
         • BLAST
           • 1. Seeding
             • 2. Extention
               • 3. Evaluation
   • Global
     • Needleman Wunsh