Flashcards
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Cards in this deck (27)
- 1Evolución viral , neo darwinismo-Variabilidad genotipica y fenotipica
Presiones selectivas
Selección de mutantes con el mayor fitness replicativo bajo esas presiones - 2Consideraciones acerca la evolución viral que la hacen muy rapida-La frecuencia de mutacion y la variabilidad genética
-El tamaño del genoma
-El impacto fenotipico de las mutaciones
-El ratio de replicacion
-El tamaño de la poblacion viral
Presiones selectivas y dinamica poblacional
Propagación viral y efecto fundador - 3Fuentes de variabilidad genética en virusMutación (es un evento cuantitativo)
Recombinación (en virus DNA y RNA)
Reordenación (en virus segmentados) - 4Diversidad del HIVLa transcriptasa reversa no tiene proof-reading, las inserciones y delecciones son frecuente en el genoma. Todos los mecanismos de recombinación tienen como consecuencia la generación rapida de poblaciones geneticamente diversas dentro de un mismo individuo infectado que pueden diferir en más del 10% de su genoma
- 5BottleneckCreados por presión selectivas, en combinación con la variabilidad fenotipica resulta en la selección de las variantes más eficientes en una nueva condición ambiental. Esto también implica una reducción del fitness
- 6QuasiespeciePoblación genéticamente heterogénea.
- 7FitnessHabilidad para generar progenia infectiva por unidad de tiempo. Las unidades para el fitness van de 0-1
- 8Frecuencia mutación RNA10^-4
El doble si es ssRNA+ - 9Frecuencia mutación DNA10^-9
- 10¿Cúal es el numero o proporción de genomas genéticamente iguales?Dependiendo de la medida sigue una curva de cuisson, esto quiere decir que habrá un fracción baja pero significativa de genomas iguales. Aunque también hay mucha cantidad de diferentes.
- 11¿Cúal es la secuencia genomica de un virus RNA? ¿Cómo puede ser un virus geneticamente definido?Hemos de aceptar que una especie vírica es una mezcla difusa de genomas parecidos entre sí pero no iguales.
Una poblacion viral existe como una distribucion dinamica de replicones relacionados pero no identicos. - 12Fitness relativaVa del 0 al 1. Un genoma tiene fitness 1 cuando el genoma es el optimo para el entorno en particular. Cualquier genoma que tenga mutaciones respecto a la secuencia optima tendra un fitness menor de 1. Si hay una mutación que impide que el virus se multiplique el firness sera 0
- 13Fitness absolutoMuy dificil de determinar
Numero de genomas hijos que un virus genera por unidad de tiempo. - 14Efecto fundadorCuando una colonia al azar de virus provoca un episodio de contagio se provoca un proceso selectivo natural que crea un cuello de botella
- 15Simulacion de quasiespecies viralesSe coje una secuencia inicial se le da una tasa de mutacion y se la pone a replicar virtualmente, se dan presiones y se deja evolucionar, al final se ve que una gran proporcion de particulas tiene secuencias muy parecidas
- 16En un genoma vírico de 10kB hay ..... permutaciones de secuencias4^5000
- 17La tasa de recambio de la hepatitis B es del ..... y la del VIH........50%
90% - 18Presiones selectivas y los efectos en las quasiespecies-El gran número de progenia producida son productos complejos de las intensas fuerzas selectivas dentro del huésped.
-Los supervivientes que pueden re infectar un nuevo huesped refleja las intensas fuerzas selectivas fuera del huésped
- Cuando poblaciones pequeñas de particulas viricas replican (como en laboratorios), fluctuaciones extremas de genotipo y fenotipos son posibles. - 19Threshold Error-La capacidad para tener un alto número de mutaciones es ventajosa.
-Tiene que haber un punto en el que la selección y la supervivencia se balanceen con la fidelidad y el ratio de mutación.
-Este límite es el error threshold, si lo excedes entonces estás muerto, si estas muy lejos de él no puedes producir las mutaciones necesarias para sobrevivir a la selección.
Los virus RNA: sobreviven cerca de sus threshold errors
los virus DNA: evolucionan lejos de su error threshold - 20Myxoma LeporipoxVirus que se solto en australia para eliminar la plaga de conejos. Tenía una mortalidad del 90-99% en conejos europeos mientras que otros animales no eran afectados.
Si embargo el virus evolucionó hacia menos virulento y el conejo hacia más resistentes o tolerantes al virus ( de otra forma se eliminarian ambos)-
Ademas el virus tambien se paso a los mosquitos en prima - 21Catastrofe de errorEl número de errores es tan grande que la mayor parte de genomas víricos que se producen no son infectivos. Esto provoca la desaparición de la población vírica.
- 22Chance of transmissionSi un virus es muy virulento aisla e inmobiliza al huesped por lo que acaba desapareciendo si no se propaga. Mientras que si es poco virulento el huesped se comporta de manera mas usual y puede ir transmitiendolo facilmente entre la población.
- 23Origen de los virus-Se asume que los nuevos virus solo se pueden desarrollar a partir de otros que ya existen, no de novo.
-Todos los virus ya existian cuando los seres humanos no existian en la tierra.
-Todos los virus humanos han evolucionado de virus animales. - 24Hipotesis del origen de los virus-Hipotesis progresiva o de escape: elementos geneticos que ganaron la habilidad de moverse entre celulas
-The regressive, or reduction hypothesis: organismos que no eran parasitos se convirtieron en estos
-The virus firt hypothesis: precursores de la vida (o que evolucionaros paralelamente a los organismos vivos) - 25Hipotesis progresivaLos virus son elementos celulares que se han independizado, es decir, que son entidades de la célula y que de alguna forma han ganado la capacidad de transmitirse horizontalmente, es decir, pasar de una célula a otra mediante una forma extracelular (la partícula vírica).
Aquí encajan algunos virus de DNA pequeños, los que actúan como mRNAs con polaridad positiva, el genoma de muchas especies víricas es un RNA que ha reclutado una serie de genes dentro de los cuales encontramos genes estructurales que permiten que el mRNA pueda salir de una célula y pasar a otra.
Hay especies víricas que adquieren plásmidos que les dan la posibilidad de salir de la célula, como el SV40 que es un virus que tiene el genoma dsDNA circular con un origen de replicación bidireccional.
Los retrovirus provienen de los retrotransposones con la diferencia de que tienen genes que les permiten vivir de forma extracelular e infectar de forma horizontal. - 26Hipotesis regresivaEntidades celulares que establecieron una relación de parasitismo con otro tipo célula (que sería el huésped) y esta relación de parasitismo ha conducido a la pérdida de funciones.
Algunos virus encajarían con esta hipótesis sobre todo los virus grandes que tienen características de virus pero que a la vez tienen muchas más funciones que no le hacen falta a un virus normal porque ya las puede obtener de la célula huésped. Son virus muy grandes que tienen más funciones que las que necesitarían un virus, son células que han involucionado (Mimivirus, Poxvirus). - 27The virus first hypothesisLo primero que va a existir en la naturaleza son los virus (antes que sus húespedes), son los precursores de la vida, esto se basa en que los virus actuales tienen genomas que son similares a los genomas RNA de los precursores de la vida, moléculas autorreplicativas con capacidad de codificar proteínas, de replicarse y capacidad catalítica, a diferencia de los genomas de DNA. A partir de estos genomas se originaron las células pero que una población se mantuvo (los virus), y fue la que evolucionó en paralelo con estas células. Los precursores son similares estructuralmente a los virus, no de comportamiento, porque de ser así necesitarían una célula que infectar ya que son parásitos intracelulares obligados.
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- Vir Flashcards on 6, created by Alba Mazo on 24/04/2017.
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- Alba Mazo
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