Digital PCR as a tool to measure HIV persistence

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1. ¿QUE ES?
   1. La PCR digital (dPCR) se ha convertido en una poderosa herramienta para cuantificar y vigilar con precisión la persistencia del VIH en las personas que viven con el VIH/SIDA.
      1. Esta técnica permite una medición sensible y precisa del reservorio viral,
         1. que se refiere al grupo de células infectadas por el VIH
            1. no producen activamente el virus pero que pueden conducir a la replicación del virus cuando se detiene la terapia antirretroviral (TRA).
2. Ventajas
   1. La eficiencia de amplificación puede verse afectada por los inhibidores
   2. La tolerancia a la variación de la secuencia objetivo es especialmente crucial para la cuantificación del VIH
      1. se espera una mayor probabilidad de desajustes con el conjunto de la sonda de cebado debido a la alta heterogeneidad del virus
3. Aplicabilidad y perspectivas futuras
   1. Donde algunas plataformas limitan el número de dispositivos especializados necesarios (microplaca del sistema de PCR digital CONSTELLATION de Formulatrix)
      1. otras compañías están trabajando en un sistema multiplex de hasta 6 colores (sistema Naica de Stilla)
      2. La plataforma de PCR digital QX200 puede beneficiarse de un clasificador de fluorescencia integrado para el análisis post-PCR de gotas.
      3. permiten el análisis de muestras múltiples en una sola pasada (QX200 de Bio- Rad)
4. Digital PCR as a Tool for Monitoring HIV Reservoirs" por Kiselinova et al. (2019)
   1. Falsos positivos
   2. ¿Que destaca?
      1. sensibilidad, precisión y capacidad para detectar células raras infectadas por el VIH.
   3. ¿Qué estudia?
      1. visión general de la tecnología dPCR y sus aplicaciones en la medición de reservorios de VIH.
         1. analizan las ventajas del dPCR sobre la PCR tradicional y otros métodos de cuantificación
5. Antecedentes
   1. La herramienta estándar para cuantificar el ADN del VIH y el ARN viral asociado a las células ha sido la PCR en tiempo real (qPCR
      1. Digital PCR se basa en el concepto de limitar la dilución donde las moléculas objetivo son dividido al azar entre una multitud de particiones
6. Retrovirology [Retrovirology] 2018 Jan 30; Vol. 15 (1), pp. 16. Date of Electronic Publication: 2018 Jan 30.