Flashcards
De l'ADN au Génotype (Blouin)
Cards in this deck (9)
- 1Cb de site reconnait une enzyme à coupure fréquente et une à coupure rare?4-6-> fréquent
7-8 rare - 2Qu'est ce qu'un contig?fragment d'ADN se chevauchant
(peut être obtenu par restriction partielle) - 3Qu'est ce que un RFLP (restriction fragment length polymorphisme) ?variation d'un site de restriction qui n'est plus reconnu
- 4Qu'est ce qu'un southern blot?electrophorese de fragments d'ADN
-> transfert sur membrane
-> hybridation ac amorces connues et labelisée
-> visualisation par radio
--> détection d'anomalie génétique - 5Comment se passe le sequencage à haut débit?1) extraction d'ADN
2) fragmentation (300-400bp)
3) liaison ac adapter aux extrémités de chaque fragment
4) liaison des fragments aux puits de la flowcell
5) amplification de brin par PCR (amorce se colle sur adapter)
6) formation de cluster pour amplifier le signal
7) polymérisation ac laser détectant les signaux des ddNTPs-> une couleur=une base à une position précise
8) on a la seq de tt les fragment-> chevauchement des seq-> alignement sur seq ref - 6Qu'est ce qu'un STS (sequence tagged site)?peut etre:
SNP
microsatellite
RFLP - 7Qu'est ce qu'un microsatellite?motif court (2-4nt) et simple répété en tendem
-> variable selon les allèles
-> fréquent ds le génome - 8Qu'est ce qui est plus précis pour cartographier le génome entre SNP et microsatellite?SNP car il y en a 30x plus que les microsatellites
- 9Quel volume de donnée représente un exome?5-10GB
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- 3e Biomed (Génétique médicale) Flashcards on De l'ADN au Génotype (Blouin), created by eliott bosshard on 19/09/2019.
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- eliott bosshard
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